如果长在肾盂里可以通过手术治疗，也可以通过碎石治疗，结石的大小与肾结石如何治疗有密切的关系，结石大，手术治疗的效果是较好的。结石偏小的情况下，可以考虑吃些排石的颗粒来治疗，不过还是在医生的指导下安全用药。
肾盂结石的治疗，一般治疗，大量饮水及调节饮食。药物治疗，主要包括积极改善症状:疼痛者给予解除疼痛;应用排石药物，直径小于5～6mm很可能自行排出;碱化尿液治疗。外科治疗，主要方法有。体外震波碎石(远端无梗阻者)、经皮肾(输尿管)切开取石术(巨大或复杂结石者)、开放性手术治疗(肾盂输尿管连接处狭窄并结石、全无功能脓肾、结石引起癌变、或体外碎石失败者)。根据结石的不同情况选取相应的治疗。
当肾结石直径大于或等于8mm时，中西医保守医治无效。当直径为10mm时，应进行体外碎石和手术取石。由于结石引起的严重尿路梗阻，肾积水无法长期缓解，当肾功能受到影响时，应尽快进行手术。当结石被尿道阻塞时，疼痛很严重，没有尿液。此时应该进行跳跃和大量饮水，这有利于排出石头。
附睾结石及时手术，如发现慢性炎症刺激，可能是炎症、疼痛、睾丸肿胀等，如果结石没有明显症状，可以暂时保守治疗，定期复查。如果保守治疗是使用消炎镇痛药，对症治疗可以缓解症状。附睾结石也称为精囊结石。生病期间不要吃刺激性辛辣的食物。不要抽烟喝酒，养成良好的工作和休息习惯。
如果孕妇肾结石的病情是轻度的，可以多饮水，减少散步的次数，增加身体的代谢速度，从而加快体内的代谢，从而加快排泄。
如果怀孕期间出现了肾结石，建议到医院进行B超的诊断。如果石头不超过2公分，建议多饮水，每天适量的锻炼，避免草酸类的摄入量。在生产完成以后采用震波进行体外碎石。如果结石比较大，可以在生产后进行外科摘除。
