中医治疗肾囊肿的方法主要以微化中药渗透疗法，使囊内液体不断减少，直至不分泌。还可以采用囊肿去顶减压手术治疗，手术减轻了囊肿对肾实质的压迫，延缓疾病的发展。生活中注意不吃过咸，过辣，刺激的食物。
当肾脏的囊肿在4cm以上、8cm以内时，这种大小的囊肿采用穿刺注射硬化剂进行治疗。如果囊肿较大，囊肿的直径大于8cm，并且对周围脏器压迫比较明显，考虑行腹腔镜肾囊肿去顶减压手术来解除囊肿对周围组织的压迫。
最佳治疗方法可以采取穿刺抽液，抽液以后注射硬化剂。注射硬化剂的目的是肾囊肿的囊内形成粘连、硬化，这样可以迫使该部位不再出现积液形成囊肿的。一般有人选择药物治疗，但是对于肾囊肿，药物治疗的效果一般都不好，所以最佳的治疗方式还是采取肾囊穿刺抽液的操作。
肾囊肿的中医治疗方法有采用药物的方法治疗肾囊肿，还经常运用针刺的方法。采用具有清热解毒，活血效果的药物，每次3～4穴，依据证之虚实而采用补泻手法，留针20～30分钟，或用灸法，2组穴位交替进行。
肾囊肿可以采取手术治疗的方法，并且要尽早的进行手术，可以取得更好的效果。手术可以减轻囊肿对肾脏的压迫，恢复肾功能，避免进一步的损伤。手术之前需要进行详细的检查，一般采用X线造影、肾脏B型超声检查或者CT检查为主。
双肾囊肿采用什么样的治疗方法，是取决于囊肿的大小，当囊肿小于五厘米的时候，是不需要治疗的，定期复查就可以，对于5到8厘米的，可以治疗也可以不治疗，这得看患者的情况，但低于八厘米以上的囊肿，建议手术治疗。
