胶囊胃镜的缺点有以下几点：
一、胶囊胃镜在部分胃肠道蠕动快时，所拍摄的照片减少，会漏掉部分的病变；
二、胶囊胃镜就能发现胃肠道的病变，但是并不能取这些组织进行活检；
三、胶囊胃镜会因为胃肠道狭窄，或胃肠道蠕动慢等情况，滞留在胃肠道内，需要行外科手术取出来。
四、胶囊胃镜属单纯筛查性检查，若怀疑小肠病变，可以做胶囊胃镜检查，但小肠病变较隐蔽，存在漏诊几率。
通常来说，胶囊胃镜不能检查肠。
胶囊胃镜通常用于检查胃部，有助于诊断胃炎、胃溃疡等疾病，不能检查肠，如果确诊为胃炎，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有胃炎宁颗粒、胃乐新胶囊、胃康灵胶囊等；如果确诊为胃溃疡，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有盐酸雷尼替丁片、兰索拉唑肠溶片、泮托拉唑钠肠溶片等。
胶囊胃镜检查与普通胃镜比较并不精确，易漏检病灶，患者要根据病情结合医生意见选择更合适的检查项目。
胶囊胃镜对胃部环境有较高要求，应确保胃内环境绝对清洁，制备需更加精细，经口腔吞入食道，胃中，然后用磁控或电控观察部位，通常存在不同程度病变漏诊。并找到病变组织不能用胶囊胃镜取出病理检查。再者胶囊胃镜的成本相对较高，不适用于普通家庭。
胶囊胃镜的检查费用大概在2500元-3000元左右一次，相对于普通的胃镜价格要高出很多，对于普通的胃部检查，使用电子胃镜检查，费用相对较低些。胶囊胃镜主要是用于检查小肠部位，因为小肠比较难于进行插管检查。胶囊胃镜的优势在于病人不会感到痛苦，只需服用一粒胶囊，然后医生会利用外部磁场来控制胶囊对病人进行检查。
一般情况下，感冒不建议做胃镜。
感冒后多数患者会出现咳嗽、咳痰、咽部不适等症状，胃镜检查需要将胃管从咽喉部送入胃腔，由于操作会摩擦咽喉部，做胃镜检查会加重咽喉部不适症状，患者会出现咽部肿胀、疼痛等。但不是感冒就不能做胃镜，只是因人而异。
在日常生活中，注意饮食清淡，多吃新鲜的水果，不要吃具有辛辣、刺激性的食物，同时还需避免过冷、过热的饮食。
怀孕可以去胃镜检查，不影响胎儿。
怀孕禁忌不包括胃镜，因此，孕妇可进行胃镜检查。但一般来说，胃镜检查需局部麻醉，可能会给胎儿造成一定的影响。在进行无痛胃镜检查时，一般都采用全麻，这样能够减轻孕妇的痛苦，同时还能减少麻醉药用量，降低不良反应率。因此，孕妇必须向医生报告怀孕的消息，医生则可根据具体情况，确定是否有必要进行胃镜检查。因为孕妇做胃镜时，身体处于一种紧张状态，容易使腹部收缩，造成出血等现象，而且还会引起疼痛，甚至导致休克。孕妇进行胃镜，其本身并不会影响胎儿，但孕妇若过分紧张，或可能流产。
因此，孕期是否有必要进行胃镜，也要听有关医生建议。
