肛门息肉的治疗主要还是需要采取手术来治疗，肛门息肉又可以分为有蒂息肉和无蒂广基息肉两种。对于有蒂息肉，可以在内镜下采取套扎术或者活检钳除，还可以通过高频电凝切除，还可以电灼烧掉。
肛门息肉，常见为炎症性息肉和腺瘤性息肉，炎症性息肉，一般治好后可自行消失；腺瘤性息肉，则需要小心，因为它一般不会消失，而且还存在恶变，甚至癌变可能，需定期检查，视情况进行切除手术。目前主流医学治疗上，以消除症状，解除痛苦为目的，而非消除痔体。
小儿肛门息肉药物内服没有明显的疗效，注意观察，如果息肉发展过快，或息肉反复感染，影响肛门清洁，尽早手术切除；平时应勤换小儿内裤，保持肛门清洁，可避免感染的发生；应增加小儿户外光照时间，可提高小儿免疫力，防止疾病的发生发展。肛门息肉，是肛肠科常见的一种疾病，不是怎么严重的疾病，没有什么不适现象，如果严重，会出现感染而致红肿疼痛。
孕妇患有肛门息肉是可以顺产的。
孕妇在怀孕之后患有肛门息肉，是可以进行顺产的。但是顺产可能会加重肛门息肉。这种情况一般可以在孕妇成功分娩之后，进行手术切除治疗。孕妇患有肛门息肉在孕期一般是不需要进行特殊治疗的，因为肛门息肉不会对胎儿的发育造成影响。孕妇在怀孕期间需要多注意休息，饮食上也需要以清淡、营养、易消化为主，防止出现便秘的情况。
娠后期一般不宜手术。孕妇痔疮发生率高达76％。主要与痔静脉受到压迫回流不畅及外来刺激有关，如果没有什么不适，暂时是无需处理的，平时不要吃辛辣刺激的食物，多吃蔬菜和水果，同时适度的活动，多喝水，保持大便的软化。
发病因素很多，如饮食因素、炎症刺激、粪便、异物刺激和机械性损伤以及遗传因素等都可能引起肛门息肉。肛门息肉可与慢性炎症刺激、遗传等原因有关，如诊断为息肉可进行手术治疗，术后并做病理检查。