精子畸形的治疗可以分为日常治疗、药物治疗，严重者可以辅助生殖技术完成传宗接代。1、纠正日常不良的生活习惯，劳逸结合均衡营养、补充精子生成不可或缺的锌、硒、蛋白质等微量元素。2、口服维生素C和E抗氧化，加快纠正精子恢复正常形态；生殖系统炎症者，或感染溶脲脲原体的患者口服抗生素和四环素类药物治疗；3、严重畸形精子症患者，药物治疗没有效果可以实施辅助生殖技术。治疗期间避免辐射，高温环境，同时戒烟戒酒。
精子畸形能中医治。采取中医的方法进行治疗精子畸形的疾病，首先还是要进行辨证的，一般中医认为，当患者肾阴肾阳失去平衡，气虚无力化生真精，就会引起精子异常，使精子改变面目。
正常人的精液中也是含有畸形的精子的，一般比例少于30%，如果畸形精子的所占的百分比高于50%就成为高畸形率精子，可能会影响男性的生育。对于有畸形精子情况的朋友来说，还是要先检查清楚自己的问题，解决清楚后，再考虑是不是要进行受孕。
想完全治疗好应该说基本上来说是不可能的。目前我国还没有什么太好的办法治疗这种疾病。如果还有正常的精子，较好去当地的三甲公立医院选择人工授精或者选择做试管婴儿试试看。别的应该说是没有什么太好的办法的。
自己的精子畸形率过高，基本上是由于先天的遗传性造成的，还有就是后天的工作环境，生活环境影响的。及时补充蛋白锌硒有助于提高精子活力，增加精子数量，提高精子质量和免疫力，降低精子畸形率，提高男性生育能力。另外，戒烟酒，忌食辛辣刺激性食物。中医治疗以“补肾活血、清热利湿”为原则，运用清热解毒、活血化瘀、补肾益气等法恢复精子的功能，效果显著。
中药治疗精子畸形的方法有：中医可以通过用滋补类中药，将他们晒干碾成粉末后装入一个我们常见的胶囊中或者就是用消毒过的纸包装起来。然后按时的服用。引起精子畸形有的是因为生殖器感染引起的，有的是因为内分泌异常和精索静脉曲张这些原因引起的。这些原因引起的精子畸形都是通过抗炎，调整内分泌和手术治疗来处理的。