药流三天后孕囊还没完全排出需要去医院清宫治疗，以免出血过多。流产后要注意休息，不要吃辛辣刺激的食物，不要过度活动，注意外阴卫生，尽早去医院做清宫术，术后在医生指导下进行药物治疗。
药流后排出完整孕囊但肚子还是一直痛是属于正常现象的。药物流产由于没有宫腔的操作，宫腔内的孕囊、蜕膜、血液等组织都需要随着子宫收缩逐渐排出体外，可能会出现1到2天的子宫收缩，子宫收缩的这个症状就是下腹部疼痛，并且有一股的血液从阴道中流出来，这种情况就是一个正常的生理反应，只有经过子宫收缩，宫内的淤血块，才能够完全地完全地排除，如果子宫收缩不良就有可能导致宫腔内残留物比较多，引起感染，甚至是凝血功能的障碍。平时一定要养成良好的生活习惯，保持外阴清洁干燥，注意卫生，少吃生冷食物，少吃辛辣刺激性食物，注意劳逸结合。
服药后应在医院观察4--6小时，有大约80%的女性在服用后的6小时内排出绒毛胎囊，还有大约10%的女性在服药的一周之内排出妊娠物。服药后8--15天应到上级正规的医院做复查，以便确定胚胎组织是否已经完全流出。
通常情况下，药流1-2小时后排出孕囊。具体情况分析如下：
根据个人的身体状况，排出孕囊的时间也不一样，一些体质敏感的人，在吃了米非司酮后，会出现孕囊排出的情况。但是大多数人在服用米索前列醇后1-2个小时内就会排出孕囊。如果超过两个小时还没有排除，那就是孕妇对这类药物的反应不是很灵敏，可以在一个下午的时间里继续进行爬楼梯，快走等运动促进孕囊排出。如果上述方法仍不能排除，建议做清宫手术。
一般情况下，药流第二天不会排出孕囊，具体分析如下：
药物堕胎都是用米非司酮软化子宫，随后应用米索前列醇，引起子宫收缩，从而将子宫内的卵泡排出。米非司酮治疗后头两日服用，不会有任何症状，少数病人会有少量的阴道出血，不过不会排出孕囊，一般是在第3天就会排出。
平时女性要注意充分的休息，重视腹部保暖，多喝温开水，饮食以清淡、营养为主，不要熬夜，有助于身体健康。
药流后孕囊排出体外不一定表明是完全流产。
用药前严格筛选，包括询问病史，进行全身体检和妇科检查，作实验室检查，如尿妊娠试验，阴道清洁度，滴虫和霉菌，血常规和血型，必要时做B超检查。药流后孕囊排出体外不一定表明是完全流产，因为即使有白色的孕囊排出体外，但还是可能会残存少部分的胎盘组织，需要在半个月左右复查妇科经阴道的超声。