如果直径小于五公分，可给予消炎类药物进行治疗，药物治疗不好或者是直径大于五公分，则需要进行手术处理，然后再辅以药物治疗。手术治疗的方式有传统的开腹手术和现在的腹腔镜微创手术，开腹手术创伤大，出血多，病人恢复慢，而腹腔镜手术创伤小，出血少，恢复快。
卵巢囊肿女性生殖器官的常见肿瘤，可发生双侧或一侧卵巢。卵巢囊肿可能会导致白带异常、月经失调、身体多毛、容颜早衰等症状，如果囊肿破裂可能还会危及生命，因此卵巢囊肿对女性健康危害很大。如果囊肿小于五厘米，一般可采取服用中药治疗，可遵医嘱服用金鸡胶囊、桂枝茯苓胶囊、止痛化癥胶囊等药物进行治疗，注意定期体检；如果大于五厘米，则需要手术治疗，一般可考虑选择宫腹腔镜微创手术进行治疗。
如果现在有卵巢囊肿的情况，这样对正常的受孕也有一定的影响的，现在可以在当地医生指导下，服用药物进行治疗。在用药治疗期间一定要注意休息，不要过度劳累，加强营养，不要食用生冷辛辣刺激性的食物。
消除卵巢囊肿适宜的食物有：牛奶、鸡蛋、瘦肉、鲫鱼等，菠菜、山药、香菇、油菜、白菜等，苹果、鸭梨、大枣、花生等；不易吃螃蟹、带鱼、青鱼、鹅肉、狗肉、羊肉、葱、姜、蒜、辣椒、桂圆、橘子等，同时要忌烟忌酒。
卵巢囊肿的治疗方式取决于患者年龄，是否恶性，囊肿的部位，体积，大小，生长速度，是否保留生育功能以及患者的主观愿望等因素而定。
卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织；输卵管卵巢切除术，年龄较大（45岁以上）或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。如果是恶性囊肿，多数患者就诊时多已达晚期，因此要尽一切可能切除原发囊肿及所能见到的盆、腹腔转移灶，通过放疗、化疗来控制病情的发展。
患者在卵巢囊肿手术以后，首先要注意多休息，不能太过劳累，这样才能使卵巢快速的恢复机能。也要注意选择一些有营养的食物来吃，如蛋类、奶类和瘦肉类的食物，这些食物比较有营养，能够促进卵巢囊肿局部的肌肉组织尽快恢复。也可以选择一些蔬菜类食物，最好选择绿叶蔬菜，如油麦菜、菠菜等，促进身体激素水平分泌正常的作用。
