宝宝半夜发烧39度应该及时遵医嘱使用口服布洛芬混悬液来治疗，要遵医嘱。
布洛芬混悬液的退热效果很好，一般在半小时之内会出现明显退热，但退热时间维持不稳定，大约4到6小时，但是该药用药间隔至少4到6小时，24小时运用最多不能超过四次，并且使用该退热药物的时候，一定及时给宝宝补水，避免造成脱水，另外要遵医嘱使用。
孩子发烧39度属于高烧，需要及时降温，可以用小儿退热栓，口服退烧药等方法降温，高烧一般是病毒性感染，常见的病毒有流感病毒，鼻病毒，腺病毒，可以用抗病毒的药物治疗，也可能是细菌性感染，常见的细菌有金黄色葡萄球菌，溶血性链球菌。
可能是病毒性感冒。及时是到医院儿科就诊，通过查体，及化验血常规等检查，明确诊断积极治疗。注意监测体温变化，体温高达38.5摄氏度以上时，需要服用退热药，同时注意保暖及休息。
通常来说，孩子体温39℃，精力旺盛，一般不会有什么问题。具体分析如下：
孩子体温39℃，精力旺盛可能是由于细菌、病毒等原因引起的。如果孩子的身体温度在38摄氏度5以上，可以立即给予孩子吃一些退烧的药物。也可以通过适当的方式进行物理降温、多饮水、热毛巾擦拭。如果孩子的病情还没有好转，可以去正规的医院进行血液常规的检测，以便尽早的缓解患儿的病情。
家长应该让孩子注意休息，保持营养均衡，早睡早起，同时适当带其到户外活动、呼吸新鲜空气，有助于身体健康。
一般情况下，两岁宝宝半夜发烧39度，可以通过药物治疗、物理治疗、日常护理等方法进行治疗。具体分析如下：
1.药物治疗：两岁宝宝半夜发烧39度，属于高热的范畴，家长可以在医生的指导下使用布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚混悬滴剂、小儿豉翘清热颗粒等药物给宝宝治疗。
2.物理治疗：两岁宝宝半夜发烧39度，可以贴退热贴、用冰块冷敷额头、温水擦浴、等，达到物理降温的效果。
3.日常护理：平时多带孩子进行体育锻炼，具有增强体质的效果，还要多晒太阳。
一般来说，2岁宝宝发烧反复39℃，需要根据实际情况进行处理，
2岁宝宝发烧反复39℃，如果宝宝精神状态好，吃东西、排便相对正常，病程没超过3天，可以遵医嘱口服布洛芬混悬液或对乙酰氨基酚滴剂之类的退热药，以及遵医嘱服用小儿柴桂清热颗粒、小儿豉翘清热颗粒等药物进行治疗。
如果宝宝精神状态不好，出现呕吐、咳嗽、食欲下降，乏力等症状，病程超过3天以上，则需要到医院检查血糖、血常规、肠道病毒检测、C反应蛋白等，明确病因后展开对症治疗。