子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
治疗的方法主要是采用药物，手术等方法进行综合治疗，去除病灶，缓解疼痛，改善病人的生育，避免复发。子宫内膜异位症这种疾病对于女性身体危害是非常严重的，这种疾病发生的原因主要是由于子宫内膜细胞生长在子宫腔之外。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。
治疗应采用如下方法。手术治疗：卵巢上发生的巧克力囊肿，病变体积往往较大，发生在其他部位的子宫内膜异位结节，直径在2厘米以上者，不易用药物控制，要把它切开，把里面的这个囊肿剥掉。假绝经疗法：使用促性腺激素释放的药物，强烈地抑制卵巢的功能，使其几乎完全失去作用，从而达到治疗目的。
子宫内膜异位症有药物治疗和手术治疗两类。手术治疗主要是针对药物治疗没有明显效果且没有生育要求者行手术，术后常常需辅助药物预防复发。药物治疗主要是抑制卵巢的功能。子宫内膜异位症常表现为进行性的痛经。
子宫内膜异位症是育龄期女性常见的良性疾病，是指生长在子宫腔的内膜，通过输卵管进入了盆腔，在腹腔内继续生长，并引起一系列症状的疾病。治疗子宫内膜异位症的根本目的是缩减和去除病灶，减轻和控制疼痛，治疗和促进生育，预防和减少复发，有药物治疗和手术治疗，可以有效治疗的。