肾积水的排出首先要找出积水的病因，治疗方法也是根据病因来的。看梗阻的性质，如先天性肾盂输尿管狭窄，应狭窄段切除并做肾盂输尿管吻合。如果是肾输尿管结石可行体外冲击波碎石，经皮肾镜，一般是要在全麻下俯卧位做。位置好的一般手术时间一个小时左右。
发现儿童轻度肾积水，需长期密切观察，定期进行超声检查，根据肾积水变化，决定治疗方案，如3-6个月一次，若肾盂无明显变化，可改为至少一年一次，多数患者恢复良好。部分患儿肾积水可随生长发育逐渐加重，必要时可进行手术干预治疗，如超声检查轻度肾积水，由5mm、1cm肾盂扩张逐渐变成2.0cm以上，肾皮质薄、肾盂张力高，此时需手术治疗。
轻度肾积水的治疗的方法得取决于其基础疾病，如果是肾结石，则可以采用药物治疗、体外冲击波碎石治疗或者手术治疗。如果是肾盂输尿管连接处狭窄，通常采用手术治疗。如果前列腺增生引起，可以服用药物治疗。
在正常的情况下肾积水的病人如果在早期，那么是应该应用整形手术，纠正单与输尿管连接部异常争取肾功能恢复正常的。如果肾积水比较严重，肾功能遭到破坏，那么就需要做肾切除手术。
怀孕后出现肾结石和肾积水是否需要治疗，要根据实际情况而定，具体内容如下：
如果结石比较小，积水很轻，患者可以多喝水，勤排尿，早期较小的结石可排出体外；如果结石比较大，肾脏积水比较重或者结石反复引起疼痛，建议等到分娩后再进行处理，以免危害身体健康，对胎儿不利。在日常生活中，患者需要养成良好的生活习惯，保持饮食清淡，少吃辛辣刺激性食物，如辣椒、芥末等。
轻度的肾积水不需要特别治疗，通常来说会被身体自我吸收的。但是如果是中度或者是重度的肾积水，要引起重视，找出原因，积极控制的，因为症状加重会影响到肾功能情况的。
