脑积水术后会脑萎缩的。脑积水是由额叶脑脊液过多引起的，这会导致脑内压力越来越大，我们通常称之为颅内压力过大。这样会发生心室扩大，可能压迫正常脑组织，使脑组织发生病理改变。也有一些先天性疾病，先天畸形、颅内出血或感染，可导致这种疾病的发生。
宝宝脑积水术后需积极的应用抗生素促进炎症消退，并且饮食也要主要以清淡为主，避免辛辣刺激这样有利于恢复。因为分流管的孔径小，在术中以引流管穿破大脑组织放入脑室的过程中，或是术后进行引流的过程中，可能会发生管腔堵塞的情况，脑室壁异常和腹腔壁均给以正常化治疗的方法，是治疗成功的关键。
脑积水可以治好，如果是急性脑积水的状态，比如在数小时或在数天之内形成的脑积水，这个时候要在急诊下行能使腹腔分流手术，这样可以有效的缓解因为急性脑积水而带来的颅内的压力。
脑积水有轻的也有重的，根据积水量的多少和压力的高低而不同，同时还要看是哪种脑积水，如果是脑室内出血、脑肿瘤或者脑外伤引起的梗阻性脑积水，常常发病比较急，脑室的扩大会加重颅内压的增高，可以诱发脑疝而致命。
术后出现脑积水，需要根据CT的检查结果来决定治疗的方法，因为脑积水也是有不同的类型和轻重之分。轻度脑积水是不需要处理的，因为轻度脑积水没有什么影响，也不会引起症状。如果脑积水比较重，那就需要进行治疗。如果是因为手术以后的脑室出血所引起的梗阻性脑积水，可以通过做脑室外引流治疗。而如果是手术以后出现的交通性脑积水，可以做脑室分流手术处理，比如脑室腹腔分流，脑室胸腔分流等。
脑积水手术一定要分清究竟是哪一种手术模式，最常见到的是慢性脑积水通过脑室腹腔分流的方式进行手术治疗。单纯从这个手术来讲解，如果想要稳定和恢复，基本上需要2-3个周的时间，病情达到相对稳定状态。