指甲表面凹凸不平主要是见于微量元素缺乏，补充钙剂，应该注意日常不要偏食，平时除食用富含动物性蛋白质的肉、蛋、禽类等，宜多进食一些含脂肪、碳水化合物（即淀粉、糖类等）较丰富的食物，还要适当多吃一些豆制品及蔬菜、瓜果等。
指甲凹凸不平可能与外伤、营养不良、银屑病、特殊行业等因素有关。
1、外伤：指甲局部受到外伤，属于一过性的损伤，可能会出现指甲不平的现象。
2、营养不良：另外如果身体缺乏微量元素以及缺乏必要的营养物质，造成了营业不良，也会导致指甲的凹凸不平。
3、银屑病：银屑病患者会出现指甲凹陷的特征。多由真菌引起的，真菌侵犯指甲部位后，指甲的表面开始感染，形成凹凸不平的改变。
4、特殊行业：特殊行业的人群，指甲长时间接触一些特殊的化学物质，也可能会造成指甲凹凸不平。
胎记凹凸不平可能长的是鲜红斑痣、皮肤癌等原因导致的，不同原因可采取不同的治疗方式。
1.鲜红斑痣：鲜红斑痣又称葡萄酒样痣或者毛细血管扩张痣，初期表现为斑块，随着年龄的增长，斑块可能会变成不规则的形状，偶尔高出皮肤表面，患者的胎记如果是鲜红斑痣，可能会随着年龄的增长，变成凹凸不平的情况。患者可以按照医嘱使用西罗莫司胶囊、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗，通常能使皮损的颜色变淡。
2.皮肤癌：皮肤癌是常见的恶性肿瘤之一，患者不仅会长有小结节，表面的皮肤还可能会轻度向下凹陷，患者如果患上了此疾病，可能会在之前长有胎记的位置发生病变，使胎记凹凸不平。患者可以按照医嘱使用氟尿嘧啶乳膏、注射用盐酸博来霉素、顺铂注射液等药物进行治疗。
宝宝头骨有些不平，这个不算异常，有个体差异，只要宝宝颅脑组织发育没有异常就行。宝宝小时候颅骨发育迅速，一般随着颅骨发育慢慢就变得圆一些了，这些坑坑洼洼也就消失了，不用担心的。
对于指甲凹凸不平需要重视，指甲可以反映人体的营养状况。如果维生素、钙质等营养成分摄入不足，就会出现指甲表面不光滑，凹凸不平，没有光泽的现象。指甲凹凸不平是因为缺钙和锌，平时注意饮食即可。