小儿肠炎的原因有很多，常见的感染性肠炎，主要是由轮状病毒或诺如病毒引起的肠道感染。除了病毒性感染外，大肠杆菌感染也会导致儿童腹泻。大肠杆菌的种类很多，腹泻的情况也不一样。还有就是志贺氏大肠杆菌，可以引起痢疾，属于比较严重的肠炎。
还有胃肠功能紊乱，因为有寄生虫感染也会导致小儿肠炎，所以首先要做鉴别诊断，通过大便化验来寻找可能的病因，比如细菌、病毒、寄生虫等，只有明确病因，才能对症治疗。所以小儿肠炎病因不同，治疗方法也不一样。
一般情况下，儿童肠炎可能是病毒感染、细菌感染等原因引起的。病毒性肠炎通常是轮状病毒感染引起的，好发于秋末冬初季节，细菌性肠炎可能是痢疾杆菌感染、真菌感染、阿米巴虫感染等细菌感染，平时吃了不干净的食物、滥用抗生素等因素，就可能会诱发细菌性肠炎。如果儿童患有肠炎，建议家长及时在儿童去医院就诊，以免影响身体健康。
大多数肠炎是由病毒或细菌感染引起的，其中病毒是最常见的。应强调持续饮食以满足生理需求和补充因病的消耗，但应根据个人情况进行合理调整。母乳喂养者应继续保持母乳喂养，人工喂养的婴儿可以用米汤或稀释牛奶或其他牛奶替代品喂养。
婴儿由于抵抗力比较差，在饮食或者生活中没注意，容易感染肠道细菌，易引起肠炎。肠炎分为轻型和重型。小儿肠炎主要的发病原因是饮食原因，因为儿童在饮食的过程中吃了不卫生的食物或者难以消化的食物，食物有很多细菌，导致小儿肠炎的发生。炎症性的小儿肠炎有很多种，包括溃疡性小儿肠炎和克罗恩病，都属于小儿肠炎。
儿童肠炎是由病毒和细菌感染所引起，所以平时要注意调整好生活作息，少食辛辣，刺激，生冷性食物，比如可以喝点清淡的汤，煮点烂的面条。避免暴饮暴食，可以少食多餐，注意腹部的保暖。