儿童抽动症主要通过药物进行治疗，同时可配合行为治疗。
在用药的时候一定要按照医生的指示，要避免出现药物的副作用，如果出现问题一定要到正规的医疗机构就医。因为不同人群之间的差别，所以使用的药品并不是绝对最佳、最快捷、最有效的，要根据具体的病情来选用最适合的药品，最常见的是盐酸硫必利片、阿立哌唑片等。还有就是可以结合中医的中药进行调理，但是要注意个人的具体情况，需要到中医科进行调理，并针对具体的病症进行针对性的治疗。
一般儿童需要综合治疗看看，可以健康教育、心理治疗、环境调整、放松训练，必要时需要药物治疗等。平时注意对儿童的抽动表现可以采取不理睬的态度，使症状逐步减弱、消退。不要反复不断的提醒和责备孩子，经常带孩子外出活动，避免让孩子过度紧张，疲劳或给孩子过重的心理负担。症状严重者可以试用相关药物。在当地医生指导下治疗。
可以尝试脑深部电刺激的治疗，就是通过神经外科微创的方法植入脑深部电刺激，也叫脑起搏器对脑深部的核团进行持续的电刺激，从而达到治疗的效果，并且这种治疗是无损伤并且可逆的。
儿童抽动症的治疗。如果孩子的抽动表现不是特别明显的时候，并没有影响到孩子普通的生活。例如因为眨眼睛、耸肩膀或者不自主的做鬼脸等抽动症状，会被其他的小朋友或者是大人问到怎么了，从而给孩子造成心理上的负担，甚至于会影响跟同龄孩子进行沟通和交流的时候。
儿童抽动症的治愈率较高，预后较好。约80%患儿经过正确治疗，基本没有症状，停药后很少复发。抽动症患者家长要正确看待该病，不可不以为然也不能过分焦虑。避免造成儿童心理压力大。如果不及时治疗，病情会逐渐加重，难以治疗。建议到正规的专科医院进行治疗。