儿童肥胖的治疗方法以饮食为主，体育训练为主，体重过重需要用药。
最重要的是要有自己的毅力，还要有父母的配合，才能避免厌食、疲倦、拉肚子，所以要控制好自己的食物，控制自己的体重，让孩子能够健康地成长。对于小儿肥胖，可以选择二甲双胍作为药物，之前是一种治疗肥胖的药物，但是FDA已经通过了FDA的审批，并且其的疗效和安全性更高，但是也不是每一种肥胖患者都可以服用。
小儿肥胖，如果超过一定的体重，首先要去医院检查，排除是否患有某种疾病，如果是由疾病引起的，可以治疗原发病，如果不是疾病原因，那可能需要进行生活干预的方法治疗。
要改善饮食习惯，不挑食偏食，适量进行运动控制体重。避免食用不健康的零食，少吃高质高糖的食物。不要吃油炸食品、垃圾食品，多食用新鲜蔬菜和水果，要多食用营养丰富的食物，多晒太阳，能够有效帮助病情的发展。
排查儿童肥胖症要先排除继发性肥胖，而继发性肥胖主要是下丘脑肿瘤导致，还有皮脂腺增多症、甲状腺功能减退症等原因，主要有以下几种：
第一，神经内分泌源性肥胖。神经内分泌系统的疾病导致的，继发性肥胖因下丘脑和下丘脑长瘤会导致激素分泌过多，从而引起肥胖。
第二，遗传综合征。一些症状可能病因不明，如色素视网膜炎、性功能减退、小胖威利综合征、多指畸形综合征，都要到医院排查。
第三，医源性肥胖。服用某些药物，如糖皮质激素、三环类抗抑郁药等，长期服用可能导致医源性肥胖。还有颅脑手术影响下丘脑也会导致医源性肥胖。儿童肥胖症要进行排查，排除继发性肥胖，再根据原发性肥胖治疗。
肥胖症是多基因的遗传。肥胖是一种非遗传性的疾病，其原因不明，可能与遗传、环境等因素相关。肥胖是一种家族遗传的疾病，这与家庭成员的不良生活习惯有关。肥胖有家族性聚合性，但其基因基础尚未明确。同时，也不能排除一些人有共同的饮食和运动习惯，肥胖是由基因决定的。肥胖病人应该采取措施减肥，比如可以通过节食和锻炼减肥。
肥胖者除了整体的脂肪含量外，还会出现局部的脂肪增多，属于脏器型的肥胖者，而脏器型肥胖者与脏器型肥胖者之间存在着较为显著的家族化特征。通常用BMI表示，BMI与BMI的乘积是相同的。若超过28，那就是肥胖症。注重膳食营养均衡，多食用高蛋白食物、新鲜的蔬菜和水果，如新鲜的瘦肉、牛奶、鸡蛋、鱼肉、橙子等。