脑干梗塞重度昏迷可能会导致严重的后果，使病人出现呼吸衰竭而死、意识不强等。需要立即送到ICU进行严密的监护和维持，并对其进行气管切开、气管插管、呼吸机辅助呼吸。在药物方面，可加强脱水，降低脑内压力，减轻脑干水肿。对符合要求的患者行消融栓塞，无溶栓的患者行微循环、促进侧支循环、抗血小板聚集等措施。可以口服纳洛酮、醒脑宁等药物，如果出现高烧，可以使用冰帽进行物理治疗。对多种复杂的疾病进行治疗，保持器官的正常运作。
通常情况下，脑溢血重度昏迷能醒，但醒来的几率不是特别大。具体情况分析如下：
脑溢血的原因是大脑中的血管断裂，导致大脑出现大出血。病情严重的还会影响到其它脏器的功能，在深度昏迷中苏醒的概率很低，现在只能勉强支撑。另外，要结合患者的年龄、病史、脑溢血的部位进行判断，最好是找医生，在医生的指导下进行治疗，不过也不能保证一定会出现奇迹。
对于重度昏迷的患者来说，在清醒之前，患者可能会表现为无意识的动作逐渐增多。对于疼痛刺激患者可能会有痛苦表情，并且肢体开始做一些躲避性的动作。在没有明显疼痛刺激下，患者可能会出现快速的眼球运动，肢体无意识的动作增多，之前一些无法引出的深浅反射会逐步恢复正常，当出现以上情况的时候，多数提示患者的意识状态，在逐渐朝着清醒的方向进展。
脑出血，重度昏迷率要看脑出血的部位和脑出血的量，如果出血量比较多在80毫升以上，一般是比较严重的，率一般在50%以上，如果出血量比较少在10毫升到20毫升之间，脑出血引起的严重昏迷主要取决于CT检查结果。如出血量大于15毫升，或出血部位较为特殊，如在脑干或丘脑，身体状况较差，不能耐受手术。
病毒性脑炎治疗方法有：保证营养的摄入量，防止窒息，对于出现高温高热的病人可以进行冷敷等物理降温；对于出现颅内高压病人要及时处理进行减压；出现呼吸困难病人要进行氧气疗法，进行病毒检测，进行抗病毒治疗。