月经老是不干净，呈咖啡色可以通过一般治疗、使用药物等方法进行治疗。
1.一般治疗：如果是腹部受凉导致的，建议注意一般治疗，即适当休息，适当使用温毛巾热敷腹部，有助于缓解症状。
2.使用药物：如果是宫颈炎导致的，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有头孢克肟胶囊、氨苄西林丙磺舒胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等。
月经不干净咖啡色应该去医院妇科就诊，做彩超检查看是否有子宫附件的器质性疾病。而且还需要考虑做激素六项，看卵巢内分泌状况，对于围绝经期的女性，还需要做妇科内检，看是否是宫颈异常病变引起。
月经期间月经颜色为咖啡色，可能是妇科疾病、宫寒等因素引起的。
正常月经血呈暗红色，还有宫颈粘液以及脱落的阴道上皮细胞。月经期间月经颜色为咖啡色，可能是一些妇科疾病，如宫颈炎、盆腔炎等，容易引起月经颜色的改变，可以选择补气血、活血化瘀的药物来治疗，如益母草颗粒帮助排出体内瘀血。月经期间月经颜色也可能是宫寒，导致气滞血瘀引起的。吃了积极的治疗妇科疾病，平时少食辛辣刺激性食物，月经期间注意腹部的保暖。
一般情况下，月经呈咖啡色量少需根据实际情况来判断，具体内容如下：
女性每月经血的数量一般在30-80ml之间，女性经期的颜色为棕色，女性来潮的量不多，在此期间有性行为，可能是怀孕的表现，不一定是因为女性生理期的饮食或者是内分泌方面的问题。腹痛也有一种是与妇科炎症有关的症状，一般不会在妊娠期间，需要结合一些活血化瘀的药物进行调理，例如口服益母草颗粒或者是喝一些红糖水。
来月经是咖啡色可能是正常情况，如果性生活时没有采取任何的避孕措施，就可能出现上述情况，引起怀孕，一般无需治疗，也可能是阴道炎、子宫内膜炎等原因导致的，建议需要在医生指导下使用抗生素、抗炎的药物治疗。此外，吃太多生冷辛辣食物、气血虚等，也可能引起来月经是咖啡色，建议到医院进行血HCG检查、B超检查等检查。
如果患者月经超过十天还有褐色分泌物，首先，建议检查血绒毛膜促性腺激素的含量来排除怀孕的可能性。其次，建议选择妇科内检。主要可以观察流血的部位是来自阴道、宫颈还是来自宫腔的哪个部位，有无阴道、宫颈的器质性病变等。在排除宫颈病变之后，通常需要进行彩超检查，观察有无子宫附件区的器质性病变。同时也要观察子宫内膜的厚度，如果内膜比较薄，此时可以服用止血药物来治疗，如果内膜非常厚，此时就需要做刮宫来治疗。