巧克力囊肿手术后怀孕有可能会对胎儿带来影响，因此需要及时到医院进行检查。
巧克力囊肿手术以后会导致盆腔粘连，影响到输卵管，因此会影响到排卵功能，因此需要及时到医院进行检查，如果影响到胎儿健康，需要遵医嘱及时的终止妊娠，因此在做完手术后应该采取相对应的避孕措施。
在恢复期间可以多补充身体所需要的营养，而且还需要适当的进行锻炼。
怀孕了有巧克力囊肿没有影响。
巧克力囊肿是因为经血排不出去造成的，如果怀孕了，就会长时间不来月经，这时候巧克力囊肿就会慢慢萎缩直至消失。不过，从万事万物的规律来看，事物总是会尽量向对自己有利的方向发展，既然怀孕会使巧克力囊肿消失，那么巧克力囊肿为了保护自己，也会减少患者的受孕几率，所以，巧克力囊肿对女性怀孕的影响是很大的。
这是好事！应该尽量把太阳给稳住，多喝些中药调理，然后定期去专业的医疗机构接受专业的治疗诊察。听筒专业人员的指导同时一定要忌口，保持正常的生活习惯，不要熬夜。吃蔬菜水果不要吃辛辣油腻的食物。配合吃药。
卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种类型，可引起进行性痛经和不孕，若可成功受孕，妊娠对子宫内膜异位症有积极的治疗作用。可以继续妊娠，卵巢巧克力囊肿一般不会发生扭转，随孕周加深，囊肿会逐渐缩小，破裂的可能性也不大，无须太过担心，孕期须注意定期产检，注意休息，避免奔波劳累，避免剧烈运动，避免性生活。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病理表现形式，即子宫内膜正常应该在宫腔内，但是有一部分内膜异位到卵巢，所以巧克力囊肿里面都是血液，子宫内膜异位不容易怀孕，囊肿小可以行中医治疗，囊肿大建议行西医治疗。
在怀孕过程中，是不会影响的，可以先不用处理的。有双侧巧克力囊肿，是由于平时的饮食，还有激素紊乱引起的，可以到医院检查，要是激素水平不是很正常的情况，可以通过药物来调理。