百日咳一般采用抗生素进行治疗。治疗百日咳的方法一般分有三种：
1、针对百日咳杆菌进行病原学的治疗，可以选用大环内酯类药物进行治疗，一般要在2-3周左右。
2、对症支持治疗，可以口服止咳化痰类的中成药或西药，配合雾化吸入治疗，减少呼吸道炎症反应，缓解痉挛性咳嗽。
3、饮食方面要注意饮食，多吃容易消化、高热量的食物。
婴儿百日咳在临床上是比较多见的，但是不是特别严重，经过正规专业治疗是可以的。可以给宝宝服用一些相关的药物进行治疗也可给宝宝雾化治疗。平时家长一定要做好护理，尽量做好隔离，不让病毒扩散。
需要按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免可诱发痉咳的因素。加强护理以预防并发症，注意营养。幼婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。平时注意多喝水，饮食要少吃多餐，不吃辛辣等带有刺激性的食物，做到室内的空气流通，保持室内空气清新，还要避免烟尘等因素刺激而诱发咳嗽。
应立即隔离并应用抗生素进行治疗。出现呼吸困难时，应及时吸氧，伴有咳嗽，痰多症状时，可以应用止咳化痰药物进行治疗。百日咳的主要临床表现为阵发性，痉挛性咳嗽，并伴有深长的鸡鸣样吸气性吼声。
小儿百日咳情况下服用镇咳祛痰的药物来治疗，如果痰液比较粘稠可以选择雾化吸入，如果经过一段时间的治疗症状没有得到缓解，是需要进行检查对症治疗，平时要注意室内空气的流通，给孩子多吃易消化的食物。
百日咳是不能自愈的。不但如此，不经过规范的治疗，病情还会进展，出现支气管肺炎、肺不张、肺气肿、百日咳脑病等并发症，严重时还可能会危及生命。百日咳需要进行药物治疗，配合饮食、调整作息等。