对于晨尿颜色为咖啡色，可能跟血尿的量，血尿的ph值以及出现部位可能有关，当来自肾脏输尿管的血尿或者是酸性尿一般颜色比较暗，可能成咖啡色。如果自己不放心，可以去医院进行下一步的检查，配合医生的结果治疗。
晨尿的颜色重，是由于日常生活起居，饮食不规律或者是由于情绪不稳定，易激动等因素引起的。
通常出现在日常生活中常大量饮酒吸烟，喜欢吃辛辣油腻的食品，同时又不注意休息，经常熬夜。这样就会出现肝胆湿热的情况，导致晨尿颜色比较重，可能像咖啡色。患者在日常生活中要注意饮食起居，要有规律生活，要适当的进行运动，常喝白开水，补充身体的水分。患者可以在医生的指导下用龙胆泻肝丸，清热通淋片等药物治疗。
尿咖啡色可能是没有饮水、肾功能受损引起的。
尿液颜色为咖啡色，第一种可能是因为平时没有饮水，进而造成尿液浓缩，但是也会因为尿液中血红蛋白较多而引发疾病。首先应该清楚病人是因为什么原因造成的，假如病人身体状况很好，而且又没有别的症状，那么就有可能会饮水减少，建议平时多喝水，但如果是身体不适情况，病人可能为肾功能受损，宜到医院就诊详查。
精液呈现咖啡色，说明精液里面有血，这种在医学上称之为血精症。最常见的原因包括前列腺炎，精囊炎等炎症疾病，也包括精囊结石等良性疾病。不过，也不能完全排除精囊肿瘤，前列腺肿瘤这一类的恶性疾病。所以一旦出现血精症，需要去医院进一步检查。
咖啡色的痰液考虑是因为血液氧化变黑，同时混合痰液而形成存在咽喉出血的情况。出现咽喉出血原因可大可小，只是暂时性多见于上火，可以选择清咽利喉的食物，宜用川贝、雪梨、冰糖做成冰糖炖雪梨食用。
一般情况下，咖啡色白带是因为分泌物中混入了少量血液，褐色白带多发生于下列情况：
1.妇科炎症：宫颈炎糜烂常发生于同房、接触性刺激导致出血之后。
2.子宫内膜炎和宫腔积液，还可造成少量出血，使白带呈棕色。
3.排卵期还可造成少量出血，因为排卵期流血是由于体内激素水平失衡。这种情况下可以通过口服避孕药或外用药来进行治疗。