当准妈妈患有甲减时，胎儿就会和妈妈来争夺甲状腺激素，一旦胎儿脑发育所需要的甲状腺激素得不到正常供应的话，胎儿脑发育就会出现异常，影响智力和生长发育障碍。而且甲减也会增加胎儿早产、死产及胎盘早剥的危险。即使顺利度过孕期，准妈妈也将面临较高患上产后甲状腺炎的风险。
孕妇甲减可以导致胎儿甲状腺发育缺陷，也可造成胎儿死亡，最主要的是造成胎儿甲状腺激素减少。甲状腺激素是维持机体正常生长发育不可缺少的激素，胎儿的甲状腺功能在妊娠第12周开始建立，妊娠前半期胎儿大脑发育所需要的甲状腺激素完全或主要来自母体，孕妇的甲状腺素特别是对胎儿的脑的发育尤为重要。
孕妇甲减对婴幼儿是有影响的。在早孕期，孕妇甲状腺功能低下会造成见红、先兆流产这些表现，甚至会出现胎停育。到了孕中期，如果孕妇的甲状腺功能水平低下，也会影响婴幼儿的智力发育。需要注意发现常和定时做好产检。
甲状腺功能减退对胎儿的影响有多大，一般情况下，需要根据实际情况来判断。
在妊娠初期，在胚胎的甲状腺尚未完全成熟以前，母亲为胎儿提供了大量的甲状腺激素。在胚胎的成长和发展中，甲状腺素是一种十分关键的激素。如果怀孕期间出现了甲状腺功能减退，或者是由于胎儿的甲状腺激素不足，会导致胎儿的大脑神经的生长，导致智商发育不良，甚至会导致胎儿流产。孕期要注意做好甲状腺激素的检查和评价。
妊娠期间甲减对孕妇的作用与甲减的严重程度有关，遗传的甲减会对胎儿的发育造成一定的不良反应，从而造成胎儿的生长发育滞后，甚至有可能造成流产的危险。
亚临床甲减是不是引起怀孕的原因，目前还没有定论，但在怀孕初期出现甲减，特别是临床性甲减，会对胎儿的长期智能产生一定的负面作用。总之，妊娠期间甲减对胎儿的影响，与怀孕期间的甲减有很大关系。
甲减会影响妇科手术，如果是甲状腺功能减退症患者，甲状腺功能不能控制在正常范围内，贸然手术可能会导致粘液性水肿，甚至危及生命。所以如果要做手术治疗，首先要做甲状腺功能检查，明确甲状腺功能状态，如果患者处于甲状腺功能亢进症或甲状腺功能减退症时期，不能完成手术，需要服用药物，将甲状腺功能控制在正常范围后再进行手术治疗。