岣巴氏腺囊肿的有效消肿仍需手术。既可采用激光手术，也可采用切除手术。
巴氏腺囊肿主要是因巴氏腺开口处发炎或者存在阻塞，巴氏腺产生黏液不能顺利流出而形成囊肿。对病情较重者需手术治疗。激光手术主要有囊肿造口术和囊肿切除术等，属于微创手术的范畴。急性期要绝对躺在床上，重视局部清洁、局部冷敷和抗生素的使用。更要重视私处卫生和经常妇科检查。
巴氏腺囊肿又称为前庭大腺囊肿，前庭大腺囊肿没有继发感染时，不需要消肿治疗，没有症状的前庭大腺囊肿可随访观察，对囊肿较大或者是反复发作者可行囊肿造口术。当前庭大腺囊肿继发感染急性发作时，应先给予抗炎治疗，可取前庭大腺开口处分泌物做细菌培养，确定病原体。如果形成前庭大腺脓肿需尽早切开引流，以缓解疼痛，脓液送细菌培养。
巴氏腺囊肿可以使用碘伏消毒，或者口服药物来进行治疗。
一般患有巴氏腺囊肿的患者多是由于混合性细菌感染所导致的，在急性炎症发作时，是需要保持外阴的清洁卫生，首先可以使用碘伏进行消毒，或者使用1:5000的高锰酸钾进行坐浴治疗。或者口服喹诺酮类，比如阿奇霉素，或者头孢菌素等口服药物进行治疗。如果已经形成脓肿，建议尽早切开引流治疗。
消肿的首选方法是在药物消炎的同时行手术切开-造口-引流，还可以采用CO2激光或者微波造口的方法。消肿后还不会复发。其次可选用外用中药洗剂，消炎止痛，但效果较慢，常用于术后护理。
手术治疗，一种是囊肿切除术，即将囊肿全部切除；但由于创伤较大，现在已经比较少用，而代之以囊肿造口术。造口术切口选择在囊肿的下方，让囊液能够全部流出来，同时用引流条以防造口粘连的下方，让囊液能够全部流出来，同时用引流条以防造口粘连。
如果发现了巴氏腺囊肿，可以去医院做手术，将里面的脓汁全部排出。
当拉力过度时，会引起巴氏腺囊肿破裂，脓汁外溢，但仅限于表面的表面。可以去医院做手术，用无菌的麻药，在手术后，将囊内的最高处剖开，这样有利于脓汁的排泄。然后在创面上做了一个小切口，然后用导尿管将剩余的脓汁排出。
在进行了手术之后，需要口服一些抗炎、消肿的药物，比如阿斯匹灵。另外还要注意个人私密部位的清洁，每天到医院换一根导流条。当脓汁完全排出后，也可以采用高锰酸钾坐浴来促进伤口的恢复，但是要在医师的指示下进行，并且要按照一定比例的比例来进行。
