进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
尿常规的检查时间，大多数选取清晨的第一泡尿，就是晨尿。选取是中段尿，排尿至一半时，再接取标本。排尿量要足一般在300ml以上，感到尿意明显时再接尿。留尿标本要在10ml以上。不建议患者从家中带来标本检查，主要是容器不能保证清洁，而且尿液存放时间长会产生一些化学反应，影响检查结果。女性在月经期间最好不要进行尿常规的检查。
肾结石的尿常规检查，可明确患者pH值、红细胞等情况。
尿常规检查以pH值，尿液晶体，红细胞和白细胞为主，对肾结石表现可起到一定的提示意义。pH值和结石的产生有一定的关系，尿结晶表明尿中可能存在结石成分。尿常规结果若有红细胞增高，表明结石是在一个集合系统中移动的，黏膜可有损伤。同时，患者也需接受微生物培养+药敏实验，利用结果，可对后续处理进行指导，选用敏感抗生素治疗疗效较好。
在临床中，经常发现有一些肾结石患者由于没有及时到医院就诊而延误了最佳的诊断时间，造成肾功能受到一定的损伤，甚至导致病情加重或者恶化，推荐及早进行治疗。
早期肛瘘通过直肠肛门指检，可以摸到条索状的一个管道、大部分通过目测和直肠肛门指诊即可检查出来，少部分复杂或难以确诊的，做腔内超声或者是肛周超声或核磁共振进行确诊，通过直肠腔内超声，能够发现直肠肛围的脓肿、管道等。
ERCP是内镜逆行性胰胆管造影的英文缩写，手术是在纤维十二指肠镜直视下，通过十二指肠乳头，将导管插入胆管和胰管内进行造影，可直接观察十二指肠及乳头部的情况，病变取材活检。
