衣原体肺炎一般指肺炎衣原体肺炎，可以使用阿奇霉素、罗红霉素等药物治疗。
肺炎衣原体肺炎是肺炎衣原体感染导致的肺部急性炎症，主要通过飞沫传播，常表现为发热、咽痛、头痛，症状通常较轻，患者可以在医生指导下使用阿奇霉素、罗红霉素、多西环素、左氧氟沙星等药物治疗。
如果是咳嗽、咳痰比较严重，可以服用氨溴索、右美沙芬等，如果体温高于38.5℃可以服用退烧药，比如对乙酰氨基酚、布洛芬等。
阿奇霉素治疗支原体肺炎的疗程一般是先连续静脉点滴五天，症状有明显改善的话可以休息两天之后改为口服阿奇霉素五天，无明显改善的话可以休息两天之后再点滴五天。
支原体肺炎和衣原体肺炎都比较严重，肺炎支原体肺炎是由肺炎支原体引起的呼吸道和肺部的急性炎症改变，肺炎衣原体肺炎多因为肺炎衣原体发病，是一种急性的肺部炎症，极容易累及到患者的上下呼吸道，可诱发咽炎、喉炎以及扁桃体炎等疾病出现。
支原体支气管炎一般是指支原体感染引发的气管炎。如果宝宝存在支原体感染引发支气管炎，可以遵医嘱吃阿奇霉素进行治疗，但是不能一直吃。
阿奇霉素属于大环内酯类一种广谱抗生素，其对于炎链球菌、支原体、衣原体等病原微生物的感染都有很好的治疗功效，一般在治疗5-7天后，便建议更换其它抗炎药物进行治疗。主要是因为在部分宝宝应用阿奇霉素后可能会出现肝功能损伤的情况，并且会引发转氨酶升高。再有就是，一些宝宝服用大环内酯类抗生素物后，容易引发胃肠道症状，如腹泻、恶心等，所以宝宝患有支原体支气管炎不能一直吃阿奇霉素进行治疗。
支原体和衣原体都是属于外源性的细菌，感染人体后都会引起一些疾病，但是这两种细菌感染的部位不同，支原体感染主要影响感染肺部的正常功能，会引起导致支原体肺炎，导致出现呼吸困难，咳嗽，发烧，咳痰等症状。而衣原体的感染主要会感染泌尿道的粘膜，导致出现泌尿道疼痛瘙痒。
衣原体肺炎可以采用大环内酯类的药物进行治疗，也可以对症进行处理。衣原体肺炎可能会出现咳嗽、咽部声音嘶哑、咽喉疼痛、头痛等症状。可以在医生的指导下，服用止咳化痰的药物进行治疗，也可以服用清咽利喉的药物进行治疗。情况严重的采用大环内酯类的药物进行治疗。衣原体肺炎治疗期间，需要注意休息，尽量不要吃油腻的食物。