应该积极的抗感染治疗，同时应该多次腰椎穿刺检查。必要时行脑脊液培养或者是脑脊液蛋白分离检查。根据结果，给予对症治疗的药物。非感染性蛋白增高，比如蛛网膜下腔出血导致蛋白增高，就应该积极的考虑腰大池引流，通过腰大池引流，来进行脑脊液的廓清作用，防止形成交通性脑积水。
患者脑脊液蛋白高，可能是中枢神经系统感染，如化脓性脑膜炎、结核性脑膜炎、脑脊液蛋白明显增高、病毒性脑膜炎、乙脑等轻度增高，建议还是要做进一步的检查，如脑脊液细菌培养、压力检查等。
如果患者做了腰椎穿刺术，留了一部分脑脊液化验，脑脊液生化常规提示脑脊液蛋白增高。说明很可能是颅内感染，或者是蛛网膜下腔出血引起的。假如患者之前并没有做过手术，也没有发热的病史，那么很可能是有蛛网膜下腔出血引起的，要进一步做脑血管造影检查，排除颅内动脉瘤。
一般情况下，脑脊液蛋白升高主要见于各种中枢神经系统感染、颅内及脊髓肿瘤、椎管梗阻、急性感染性多发性神经炎、甲状腺功能亢进、糖尿病等。具体情况分析如下：
脑脊液蛋白含量增加是由于脑膜、大脑或脊髓炎症改变引起的。脑脊液蛋白质含量增高是血脑屏障功能障碍的标志，脑脊液蛋白蛋白来源于血清，可以反映血-脑脊液屏障的完整性。
脑脊液蛋白正常值，人们处于各种年龄，蛋白含量不同。
脑脊液为人体颅腔内正常液体组织，外观无色，透明，清澈，轻微发黏，为液体组织，在该液体组织内，存有电解质，蛋白、白细胞和其他材料。脑脊液蛋白正常值，人们处于各种年龄，蛋白含量不同。早产儿身高较高，每升可达2克；新生儿的体重逐渐降至每升1克；作为一个正常的成年人，通常每升可达150~400毫克。蛋白含量一旦出现异常升高，通常认为颅腔内有无感染存在，颅腔内有无流血。针对具体情况进行了具体的分析。
首先是感染，以化脓性结核性脑膜炎，脑脊液蛋白质，增高最明显。病毒性脑膜炎则轻度增高。神经根病变常见于急性感染性多发性神经根神经炎，有蛋白质细胞分离的现象。梗阻脊髓肿瘤、肉芽肿硬、膜外脓肿造成的椎管部分或者完全梗阻可以有脑积液自凝现象。出血、脑血管畸形、高血压病、脑动脉硬化症以及全身出血性疾病等。其他的如肺炎，尿毒症等。出现中枢神经系统症状时脑脊液蛋白质含量也可以增高。
