肾囊肿是否会引起腰疼，要看囊肿的部位、大小和数量。囊肿直径小于五厘米的情况不会有任何感觉和不适。若囊肿直径比较大，会产生疼痛，如是合并感染，会因为感染出现发热胀痛的情况。
肾囊肿是成年人肾脏最常见的一种结构异常，单纯肾囊肿一般没有症状，只有当囊肿压迫引起血管闭塞或尿路梗阻时可出现相应表现，有可能对肾功能产生影响。囊肿体积较小，但是有腰痛症状，建议去医院复查一下，如果体积增大，可以囊液抽吸术并囊内注射硬化剂或行手术治疗，没有特别有效的药物对于肾内囊肿治疗。
多吃一些清淡的食物，如新鲜的蔬菜水果等，不能吃过于油腻的食物，也不能吃辛辣刺激性的食物，如果想早点治好，不能只靠药物进行治疗，使用药物治疗只能暂时压制住病情，需要及时的到医院进行治疗。
肾囊肿可以由很多原因引起，先天遗传因素是肾囊肿最常见的原因之一，基因突变也是引起肾囊肿的发病原因之一，各种中毒对肾脏的损伤，例如常见的毒物有农药、化学制剂、放射线、污染等都会引起肾囊肿。具体原因可以到医院进行检查。
应该再对其右肾的部位进行检查一下，看看是其右肾有这样的病症没有，如果其腰痛的症状是与肾囊肿有关，那就是通过手术的办法将其肾囊肿进行摘除，就可以了。如果右肾发现有疼痛的感觉了，那就是有可能是其右肾也发生囊肿的病症了。