肛瘘主要是由于肛窦腺体发炎，形成肛门直肠周围脓肿，脓肿破溃发展而来，或肛周脓肿术后引流不畅成为外口，脓肿逐渐缩小，形成感染性管道，肛瘘有1个内口和1个外口，瘘管行走在肛门内外括约肌附近，常迂曲，引流不畅，而外口皮肤生长较快，从形成假性愈合。
肛瘘多是非特异性感染的，少数为结核性的。要去当地正规专业医院检查病因后治疗。肛瘘是肛门直肠瘘的简称，是发生在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流的后遗病变。肛瘘是脓肿后时代，是一个疾病的两个阶段。英文名Analfistula，中医称为肛漏。
肛瘘分多种类型，括约肌间性，经括约肌型，括约肌上型和括约肌外型，前两种常见，后两种少见而且处理困难，一般肛瘘自愈几率特别少见，几乎大部分需要手术处理，需要经外面的外口沿着瘘道把感染的内口切除，术后配合换药。
肛瘘的形成多见于肛隐窝炎，肛窦炎，反复的炎症感染刺激出现的肛瘘，一旦确诊肛瘘，治疗方案就是进行手术切除，尽量找到内外口，容易恢复高位的需要进行挂线疗法，注意局部的卫生，避免辛辣刺激的食物。
肛门直肠周围脓肿是引起肛瘘的根本原因。脓肿破溃或切开后不能愈合，最终形成瘘管。对于肛瘘的治疗非手术治疗没有效果，只能进行手术肛瘘切除以达到治好。要尽早到正规医院的肛肠科门诊就诊，明确检查并采取正规的手术治疗。