肺炎支原体感染最常见的症状以咳嗽为主，随着病情的进一步发展，会出现一些白色粘液痰，如果病情没有得到控制，痰液会变得更加粘稠。当患者确诊时，肺炎支原体感染，经常会出现胸痛的症状，让患者深呼吸时病情会进一步恶化。如果发生在大人的身上，很多人在肺炎之前就已经患上了呼吸道感染。身体在出现肺炎支原体感染时，体温会变得很高，类似这种情况，如果发生在婴幼儿身上，可能会危及婴幼儿生命。
女性支原体感染以后，症状因感染部位而异。
若为泌尿生殖器感染，则可有尿频，尿急等症状、也有尿痛，若为宫颈感染，可有白带增多，浑浊等，宫颈水肿状况；若为呼吸道感染，可有咳嗽。
该病具有自限性，大部分病例未经治疗即可自愈。如果症状严重，可以采取喹诺酮类抗生素治疗。
支原体感染者的症状和支原体感染的部位相关。
支原体感染往往是肺炎支原体感染，出现发热、头疼、咳嗽、虚弱等症状，或泌尿生殖道支原体感染吗，发生尿频，尿急，尿痛，排尿困难，尿道灼热感等不适。另外，在皮肤黏膜，中枢神经系统、心血管系统、骨关节系统也可能会有不正常表现。
孩子支原体感染可表现为头疼、咽痛、肌肉酸痛，同时可出现全身无力，食欲减退等。支原体感染以阵发性刺激性咳嗽最为显着，此咳通常痰液较少。
支原体感染尤易并发支原体肺炎，但支原体肺炎通常病人体征相对轻微，临床中影像学变化较为严重，需要及时采取治疗。
女性支原体感染有分泌物异常的症状。
支原体感染又称为非利菌性尿道泌尿生殖道炎，主要通过性途径传染，对身体有很大的影响。女性支原体感染后，一般会出现阴道分泌物增多、分泌物异味等症状，还可能伴有外阴局部瘙痒的情况。不过也可能不会很明显，建议要到医院进行专业的化验。
HPV不是支原体感染。
HPV指人乳头瘤病毒，能引起人体皮肤黏膜的鳞状上皮增殖，不是支原体感染。人乳头瘤病毒是一种病毒感染，支原体是一种介于病毒和细菌之间的微生物感染。支原体感染可以使用抗生素治疗，而对于高危人乳头瘤病毒感染目前还没有很好的药物。