小儿自闭症通常是先天的。
小儿自闭症是一组遗传因素和环境因素共同作用所致的疾病。患儿在社交方面存在缺陷，表现为回避目光、对呼唤缺少反应等。目前自闭症的研究可能跟某些基因有关，所以有一定的遗传倾向，但是如果后天缺乏父母的关爱，父母和孩子之间缺乏沟通，就会导致自闭。主要表现为不合群，脾气暴躁，不听大人的话，喜欢看动画片，智力发育迟缓，不能参加集体活动。
小儿疝气可能是先天的。
儿童疝气分为先天性和后天性两种，一般是先天性的，因为先天性的解剖学上的问题，在胎儿的初期，睾丸在腹膜后二至三个腰椎间盘，然后慢慢向下，在腹股沟的深处，在腹股沟的深处，会带动腹股沟，腹部的肌肉通过腹股沟的管道向下移动，从而产生一个阴袋，随后腹膜向下移动，形成一个鞘状的突起，然后是一个包裹着睾丸的鞘状突起，然后是一个紧靠着后面的脊索，这个过程叫做“固有的”。剩余的则是自然的收缩和封闭，只留下一条纤维索。如果没有完全封闭或者是没有形成完整的，那么就是先天性的斜疝。
小儿疝气是先天性的，它是因为先天性的解剖结构鞘状突在出生以后没有闭塞，在腹股沟区遗留一个通道。
在腹压增加的诱发因素下，腹腔内、盆腔内的脏器比如说肠管、卵巢、子宫等通过这个通道由腹腔或者盆腔下降到腹股沟区或者阴囊内，形成一个质软的、可回纳的包块。小儿疝气往往不能自行愈合。保守治疗没有明显的效果，需要手术治疗。
横膈疝一般都是要进行手术的，据数据显示，在没有手术的情况下，一个月之内，有75%的原因会导致婴儿死亡。但是，产后两日之内做外科治疗，死亡率高达百分之五十到百分之七十五，产后两周做外科治疗，死亡率会大大下降。所以，手术时间的选取非常关键。一般是在分娩两个星期之后再进行一次，因为那样会大大减少孩子的死亡率，所以建议怀孕期间要多做一些彩色超声检查，如果是3D检查，确认之后再作选择。
儿童先天性髋脱位是指发育性髋脱位，具体的症状取决于儿童的年纪，脱位的程度，单侧性和双侧性的病变。
主要症状有一种是蹒跚走路，这是幼儿常见的症状，一侧患者的身子朝一侧倾斜，两侧患者出现明显的鸭子步幅，腰部和髋关节突出。一侧脱位患者的双腿长度不均匀，臀部皱纹、股纹不均匀，而在双侧患者则表现为会阴区增粗。此外，还会出现大粗隆升高凸起，在髂前上棘到坐骨结节之间的连接处有大粗隆。
肝移植是先天性胆道闭锁发展至终末期惟一有效的治疗手段。在小儿（年龄小于18岁）肝移植中，先天性胆道闭锁所占比例接近一半，其中1岁以内中，所占比例约90%。葛西手术后约67%的儿童在成人之前仍需要肝移植救治，由此，葛西手术成为了病人在接受肝移植以前的一种过渡性治疗。通常，病人接受肝移植手术时机被认为是葛西手术术后胆红素持续在10mg/dl以上和年龄120天以上肝脏已出现明显硬化。
