腰穿取脑脊液是有风险的。如果是后颅窝病变，或者是高颅压，那么腰穿很有可能会引起脑疝，这是因为在释放脑脊液后，蛛网膜下腔的压力会下降，大脑组织会下沉，从而引起脑干在枕骨大孔处的嵌顿。脑疝可引起中枢性的呼吸循环紊乱，严重威胁到病人的生命。另外，有颅内动脉瘤的病人，由于腰穿压的改变，会引起动脉瘤破裂出血。其它的危险包括穿刺损伤，局部感染，低颅压头痛，麻醉药物过敏。
正常的脑脊液是清晰透明的。脑脊液的透明度与它所含的细胞数量以及细菌的多少有关。脑脊液白细胞超过300乘以10的6次方每升时呈浑浊状态。脑脊液蛋白质明显增高，或者是还有大量的细菌、真菌时也可以使脑脊液混浊。
脑脊液常规化验检查中，白细胞计数正常值是0-5。所说的白细胞其实就是有核细胞。如果脑脊液常规化验中的有核细胞数，显著增高，超过500，应该就是细菌感染或者化脓性脑膜炎，需要进行治疗。
通常情况下，腰穿脑脊液查颅内压是否升高、中枢神经系统感染、蛛网膜下腔出血等。
脑脊液是存在于脑室及蛛网膜下腔的一种无色透明的液体，比重为1.005，总量为130～150ml，平均每日产生量为524ml，通常包围并支持着整个脑及脊髓，有效地使脑的重量作用减少至1/6，对外伤起一定的保护作用。而腰穿脑脊液，一般是查颅内压是否升高、中枢神经系统感染、蛛网膜下腔出血等。
一般情况下，脑脊液生化检查以下内容：
脑脊液的生化检测包括脑脊髓液中蛋白含量、糖含量、氯化物含量等。在这些因素中，糖分和蛋白质含量是一个比较关键的参数。大多数的脑炎、脑膜炎等都会导致脑脊液中的糖水平下降；但是也有一些特定的疾病，比如病毒性脑膜炎等，可以引起脑脊液中的白细胞和蛋白质数值增高，但是糖份的浓度还在正常范围之内。
不会对病人的身体产生什么危害。腰穿的全称是腰椎穿刺术，是在局部浸润麻醉的条件下，利用腰穿针，在病人的腰椎间隙之间进行穿刺，穿刺针到达病人的腰大池区域。可以测定病人的颅内压力，同时也可以做压颈试验了解脑脊液循环是否通畅。
