导致这种情况的原因有很多方面，具体做法如下：
1、甲状腺炎：如果患者甲状腺感染细菌或病毒，出现甲状腺炎反应，甚至弥漫性病变，在彩超检查中表现为回声不均匀，需及时治疗。甲状腺炎患者可口服左细胞分裂素片治疗。
2、甲状腺结节加重：患者甲状腺结节加重，尤其是出现甲状腺癌，在彩超检查中可表现为回声不均匀。患者可进行放射性碘治疗，放射性碘被甲状腺结节吸收，结节逐渐缩小，可减轻甲状腺结节加重症状。
3、甲状腺肿瘤：彩超检查，即使甲状腺组织中出现一个(部分为多个)异常占位性病变，也会引起回声不均匀，边界不清，表面不光滑，形态不规则，应于手术直接切除原发灶和可切除转移灶。
甲状腺结节内部回声不均匀，提示有甲状腺疾病。比如甲状腺功能亢进，甲状腺功能减退，桥本氏甲状腺炎，亚急性甲状腺炎等，需要到医院来进行进一步检查。甲状腺结节的回声是超声下的描述。
甲状腺结节内部回声不均匀，不排除可能是恶性结节。
甲状腺腺体内恶性结节，通常为单发病灶，无完整包膜，超声提示供血明显，可表现为散在钙化特征性改变。恶性结节亦需核素扫描，多呈冷结节，但应及时切除手术，术中亦需冰冻病理学检查，颈部淋巴结扩张。恶性结节患者在手术及以后需定期监测甲状腺功能变化或接受甲状腺彩超检查。术后需长期口服甲状腺激素片，故常用优甲乐。还要注意饮食烹饪，适当补充高热量、高蛋白的食品，控制含碘食物的摄入量。
甲状腺结节低回声边界清可能会引起甲功异常，可以做甲功七项检查，并定期复查甲状腺超声检查看看结节增大与否，如果超过了一个厘米需要做细针穿刺细胞学检查。
可以手术治疗，甲状腺结节是一种常见的甲状腺疾病，甲状腺上的结节可能是甲状腺癌，也可能是甲状腺瘤，结节性甲状腺肿等其他病因，在未明确其性质以前统称为甲状腺结节。B超检查是甲状腺结节首选的诊断方法，B超检查可判断甲状腺结节是单发还是多发。
提示甲状腺结节边界不清，可能为恶性。
需前往甲状腺专科行甲状腺结节穿刺活检确诊疾病。良性的情况下，建议重新审视甲功八项，调查甲状腺功能是否正常。一切正常时，建议每半年至一年进行一次甲状腺检查。穿刺结果为甲状腺癌等恶性时，进行全身评估，根据结节大小和有无淋巴结转移制定手术方案。即使甲状腺癌疾病是恶性的，预后也非常好，应及早处理，尽早完善检查，尽早评估。