如果是三个月孕程，最好不要做磁共振检查，可以做B超进行检查，对孕程三个月以上的胎儿，可以做磁共振检查，但是磁共振设备不要超过1.5T。
虽然超声检查是进行胎儿畸形的首要检查方式，但是由于技术和设备的影响，也许并不能精确的检查到胎儿畸形的状况，而磁共振检查不会有任何的缺陷，相反还具有分辨率高和视野广阔的独特优势，所以可以准确的检查到胎儿是否有畸形的状况，但是怀孕三个月左右进行磁共振检查，可能是会对胎儿产生影响的。
在怀孕初期要避免吸烟、喝酒以及吸二手烟，而且男方也要戒烟酒半年再要孩子，因为这些都是会导致胎儿畸形的。
胎儿磁共振检查是帮助患者弥补超声检查不足的方法。当下，检查胎儿、胎盘和羊水状况的主要方法为产前超声，但受到孕妇肥胖、胎儿体位等因素的影响，产科超声无法进行检查，此时就需要进行磁共振检查。磁共振可以检测胎儿有无畸形、胎盘情况、羊水情况、子宫畸形、多胎、妊娠合并子宫肌瘤、卵巢肿瘤等情况。不过在怀孕的三个月内，胎儿的各个器官都在进行发生分化，所以不宜进行核磁共振检查。
脑炎需要做磁共振。
如果是脑炎，通常要进行头部MRI检查，最好是进行头部MRI检查。如果病人有如此大面积的病变，或是有炎症的肿胀，脑部核磁检查可以检查到某些不正常的地方，例如，病人是由于病毒引起的，可以在海马区找到病变。有些脑干性脑炎病人还可以在脑干上找到病变。除此之外，还要进行脑脊液和腰椎间盘的定性分析，根据脑脊液来判断是否是细菌、真菌、病毒等。
在做产前MRI的时候，需要考虑到胎儿侧脑室增宽，有没有钙化灶，有没有软化灶，有没有脑出血，有脑血管异常，也有可能是头部太大，也可能是头部太大。经核磁共振对胎儿头部进行诊断，以确定是否存在头部器官损害。怀孕22-26周时进行B超检查，发现有可能是胎儿的头部有问题，建议做头颅、MRI。明确诊断后再进行相应的处理，有明显的不正常会对孩子的智商造成一定的损害，建议进行引产手术来结束怀孕。
普通B超是能够看出胎儿畸形的。普通B超除了进行胎龄的判断、多胎的测定、胎盘位置以及羊水测量这些常规检查外，对胎儿畸形的检测也是其重要的内容。在怀孕16-24周时，有六种胎儿畸形B超必须要检出来，包括无脑儿、开放性脊柱裂、致死性成骨发育不全、单腔心、脑膨出、胸腹壁缺损内脏外翻。一旦检出这些重大畸形，原则上是要终止妊娠的。
对于骨折的患者，要不要做核磁共振，首先要看骨折的位置，一些关节内部的骨折，比如胫骨平台骨折、胫骨髁间嵴骨折，需要做x片检查，同时还要进行核磁共振检查，以排除关节中的韧带和半月板的损伤。另外，一些骨折患者，比如股骨干骨折，一般不需要做核磁共振。对于有关节受伤或相邻关节骨折的患者，最好做核磁共振。建议患者及时就医。
