一般情况下，阴茎上的水泡可能是真菌感染、生殖器疱疹等因素造成的，患者应对症进行治疗，具体内容如下：
1.真菌感染：不洁性行为、不注意个人卫生等因素可能导致患者阴茎出现真菌感染，可能出现阴茎上长水泡的情况。患者应遵医嘱使用特非那定片、维生素C片等药物进行治疗，还要注意保持阴茎清洁、干燥。
2.生殖器疱疹：如果患者患有生殖器疱疹，阴茎上可能会出现水泡。患者应及时就医，在医生指导下使用阿昔洛韦片、伐昔洛韦片等药物进行治疗。
一般情况下，阴茎上的小水泡，患者可以通过药物治疗、日常护理等方法进行改善。
如果是单纯疱疹病毒引起的，那么阴茎上就会有一个小小的水泡。首先明确是否有过不干净的性行为，如确认为生殖器的疱疹病毒，则是性传播疾病。可以在局部使用碘伏进行杀菌，也可以使用阿昔洛韦软膏、干扰素软膏等外用药，也可以服用更昔洛韦片、阿昔洛韦等口服药物，日常生活中要注意避免食用辛辣、刺激的食品，避免吸烟、喝酒；同时，不能发生性关系，否则可能会感染到性伙伴。
生殖器疱疹复发率是相当的高，治疗有两个原则，一，坚持治疗.因为疱疹病毒非常顽固，杀灭的过程比较长，所以要做好三个月至半年的杀灭准备。在患病期间，少食辛辣油腻食品，因为生殖器疱疹活动期的皮损表现属于中医学中的热证，而辛辣之品有助热发散的作用，可以加重局部症状；在病毒静止期，可以多进食一些富含蛋白质和维生素的食品，并且锻炼身体，以增强体质，增强免疫力，减少复发。
不必过分紧张，规律生活，加强锻炼，经治疗后，随身体免疫能力的增强，复发次数会逐渐减少或不再复发，治疗期间避免劳累、饮酒，忌性生活，平时注意自身生活的清洁，必要时可去医院检查治疗。
导致阴茎上长水泡的有两种可能，一种是包皮过长，另一种是生殖器疱疹。包皮过长就采用包皮环切术治疗，可以缓解病情。如果是生殖器疱疹，可以采用口服或注射抗病毒类药物治疗。
