西医治疗的基本原则是消炎杀菌，内外并治。珠菌性龟头炎可给予局部用肥皂水冲洗，然后涂抹外用软膏。治疗期间禁止性生活，每天更换烫洗暴晒内裤。需要夫妻同时治疗。生殖器念珠菌病绝大多数是一种条件致病性感染，除不洁性交引起本病的感染外，个体所患的某些疾病也是引起本病的原因。
治疗念珠性龟头炎应注意清洁卫生，勤洗澡、勤换内裤，不要发生婚外性生活，应遵守行道德。万一发生类似情况应戴避孕套，注意清洗。外部治疗用清水清洗，局部外用无刺激性的抗真菌乳膏等，还可以用外用抗药物维持疗效。
念珠菌和杂菌龟头炎治疗最近不要吃辛辣刺激性海鲜类食物，多饮水，多吃清淡易消化食物，每天清洗后外用乳膏，内裤清洗后暴晒，用苏打水清洗外生殖器，并注意保持会阴部清洁，勤换内裤，内裤与鞋袜不要一起洗，用热水洗后在阳光下暴晒，夫妻双方应同时治疗，治疗期间禁止性生活。
念珠性龟头炎可以口服抗真菌药物来治疗。治疗念珠菌性包皮龟头炎要强调男女性伴必须同查同治，通过局部治疗、口服药物治疗或联合手术治疗，达到控制感染的目的。经积极治疗，念珠菌性包皮龟头炎预后较好。如果存在包皮过长或包茎、糖尿病等易感或继发因素，将增加治疗难度，并且容易复发。
念珠菌性包皮龟头炎在西医治疗的基本原则是消炎杀菌，口服和外涂具有消炎杀菌作用的药物，一般是内外并治。中医治疗本病常把其分为三型，即毒火郁结型、湿热生虫型和肝肾阴亏型三种。根据不同的临床表现予以不同中药的治疗。
念珠菌性龟头炎发病初期，可见龟头和包皮表面水肿、充血，尿道口周围发红，并出现创面糜烂，可发展成浅表的溃疡，有脓性分泌物流出，患者自觉龟头处发痒或灼热感。念珠菌性龟头炎患者应注意清洁卫生、勤洗澡、勤换内裤。
