肾结石疼痛的部位和结石的部位有关系。如果结石是在肾脏，是腰区疼痛，就是脊柱两侧腰痛。如果有小结石排到输尿管，可以出现腹痛，腹痛的性质比较剧烈，呈绞痛性质，可以伴有向会阴部放射。
肾结石的疼痛主要常位于病人的脊肋角、腰部、上腹部，多数呈阵发性，亦可为持续性。严重时面色惨白，出冷汗、脉细而速，以致血压降落呈休克状态。同时多伴有恶心呕吐、腹胀便秘。绞痛发作时，尿量减少，缓解后可有多尿现象。
通常情况下，肾结石更容易引起患者的疼痛，尤其是腰腿疼痛。
肾结石有疼痛一般情况下都属于正常现象。患者有疼痛，应该及时去医院检查，同时也应该接受正规治疗。肾结石发病初期，若是形成急性梗阻的话，那么就会引起腰部疼痛较为剧烈，要及时去医院做详细检查，以明确结石具体病情，之后再对症治疗一些。如解除输尿管痉挛止痛药物等对症处理，此痛可有减轻。与此同时，对于肾结石也要积极的治疗，只有把肾结石完全的排干净了，这样的痛苦才能得到完全的治愈。
肾结石主要是腰背部疼痛。结石的位置不一样，疼痛的性质也不一样。如果是肾盂内大的结石，或者肾盏的结石，一般没有明显的疼痛，也没有明显的临床症状，主要是活动后出现上腹部、腰部钝痛的表现。当肾脏小的结石由肾盂排到输尿管时，会引起肾绞痛或者输尿管绞痛的表现，最典型的表现是阵发性的腰部疼痛，或者上腹部疼痛，疼痛剧烈难忍，疼痛阵发性的加重，疼痛时可能会有恶心、呕吐、血尿等症状。
肾结石疼痛在医学上被分为是11级疼痛，它是内脏疼痛。最严重的疼痛分级是12级，就是母亲的分娩痛。肾结石的疼痛是因为结石排泄过程中导致输尿管痉挛，肾脏积水，疼痛呈阵发性绞痛等。
