要到医院进行检查囊肿的大小，性质，增长速度等进行相关的治疗。腹腔镜下卵巢囊肿剥离术不需开腹不切除卵巢可最大限度保留生殖器官完整性及生育功能。腹腔镜手术治疗，再监测卵泡。在排卵期性生活怀孕几率最大。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成的，一般卵巢巧克力囊肿会引起进行性的痛经，同时可能影响怀孕甚至导致不孕，当卵巢巧克力囊肿小于五公分以下，又没有明显严重痛经的时候，可以考虑采用短效避孕药来进行调理治疗，如果是卵巢巧克力囊肿大于五厘米，我们通常建议直接行腹腔镜手术切除囊肿才行。
巧克力囊肿是会导致不孕的。至少会造成排卵障碍。卵巢巧克力囊肿的形成是由于内膜在卵巢中仍然会出现“经血”症状，但由于在卵巢内无法排出，日积月累就造成了旧血的长期潴留，形成囊包。
建议直接到医院检查，巧克力囊肿复发会导致一系列的妇科问题，包括慢性阴道炎等，如果巧克力囊肿真的复发了，需要引起重视并且再做一次手术切除。平时的时候需要注意个人清洁和卫生，不要和其他人共享洗浴用品。
巧克力囊肿可采用腹腔镜手术，在腹腔镜下对囊肿进行切除。术后打针阻断内膜异位症的复发，阻断巧克力囊肿复发可以用一些药物。手术刀口较小，对身体的损伤和痛苦也会小很多。
巧克力囊肿复发方法是在超声引导下的细针穿刺中药硬化剂的方法，可避免囊液外流的问题，确保了不会复发。不手术，对卵巢功能不受任何影响，这种方法治疗后，不影响以后怀孕，是目前治疗巧囊的方法。
