脓肿是急性感染，切排后是形成肛瘘即慢性感染，再有脓肿形成是肛瘘伴发急性感染。由于小孩肛瘘有可能自愈，所以目前需要控制急性的感染，包括适当扩大外口，给予充分引流，及适当使用抗生素。加强营养。防止再次急性发作。如果反复多次发作，要检查原因，必要时需要进行肛瘘的手术、彻底治疗。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
肛周脓肿初期症状主要是哭闹，接触肛门或排便时哭闹加重。随着脓肿形成，可以见到肛周红色肿块，起初肿块质硬，逐渐肿块中间变软破溃溢脓，形成肛瘘，这时患儿哭闹减少，破溃口会反复溢脓。
肛周脓肿的表现症状会出现发热，红肿，浑身无力，食欲不振，瘙痒等症状，肛周脓肿可以配合医生口服一些药物来治疗，严重的情况下还需要通过手术的方法来治疗，肛周脓肿通常是便秘导致的一种疾病，新鲜的蔬菜和水果，多吃苹果。
常见的肛门周围皮肤下是有很多脓肿的，大多数都是因为肛腺被细菌感染后经外括约肌皮下部向外或直接向外扩散而成的，婴儿的肛门周围脓肿经常位于肛门周围皮肤下部，脓肿一般大小不是很大。