如果反复的发作的话，还是需要进行手术治疗。如果是不严重，白细胞不高的话，是可以进行保守治疗。保守治疗的方法，就是静脉输液输入抗生素治疗，疗程一般是七天，可以防止宝宝反复的发作。如果治疗不好的话，就需要进行手术治疗。
肛周脓肿的明确诊断还是要依靠肛肠病专科医生的对患儿肛门局部的检查，必要时行局部或腔内B超检查以明确病变的范围。如果局部肛周脓肿的没消退反而增大，或局部变软，说明局部已成脓，可以选择切开排脓，引流通畅即可。
肛周脓肿是肛周感染的后期症状，肛周脓肿如果没有得到有效的控制就是肛瘘.如果肛周脓肿的脓包不大，皮肤能代谢下去，一般不会发展成肛瘘.如果肛周脓肿包很大，而且出脓头，破脓了，70％的人结果都是肛瘘.肛瘘只有开刀了。
痔疮手术后肛周脓肿，可以切开引流换药治疗，静脉滴注消炎药物，多吃新鲜蔬菜水果，少吃辛辣刺激性食物，注意休息，保持大便通畅。平时少吃辛辣刺激性食物，多吃新鲜蔬菜水果，多喝水，定期换药，保持引流通畅。
出现疼痛的时候需要用消炎药及时的消炎治疗炎症才能够缓解疼痛的现象，肛门脓肿是由于炎症感染严重的时候才会出现疼痛的感觉，不要吃辛辣刺激性的食物，避免加重炎症感染的症状，加重疼痛的现象。