脑干出血恢复期的长短与脑干出血的数量和影响的程度有关，一般在3个月至6个月之间，还可能会留下比较明显的后遗症。因为脑干是中枢神经系统中最重要的器官，它涉及到人体的很多重要功能，特别是呼吸循环，所以脑干出血一般都会出现不同程度的昏迷，大部分患者会在两个星期内因为并发症而死亡。极少数患者在接受全面的治疗后，可以活下来，但是他们的身体会出现麻痹、肌肉紧张、生活质量降低、甚至是植物人的情况，需要长期的康复，可以通过高压氧、针灸、理疗、脊髓电刺激等方法来缓解。
脑干出血虽然不能完全恢复，但可以通过康复疗法来恢复。首先，脑干出血是一种非常危险的脑血管疾病，通常3mL的脑干出血会引起严重的脑功能损害，从而引起不可逆的神经功能障碍。如果脑干出血超过5mL，病人就会昏迷，有生命危险。其次，脑干出血，病人有可能从偏瘫发展到肢体麻痹，这种情况会对脑干出血的病人造成一定的影响。
脑干出血康复的方法主要有高压氧、中医针灸理疗、语言功能训练、肢体功能康复锻炼、药物治疗、神经电刺激等方法。因为脑干出血属于神经系统受损，神经细胞具有不可再生性，神经细胞黄金康复期为出血后半年之内。因此，一定要抓住黄金康复期这一时间段，尽早介入康复治疗。
尽量选择比较安静，阳光充裕的环境，同时可以给患者适当的使用软化大便的药物，以帮助顺利排便，有明显的精神症状，可以考虑使用一些抗焦虑，抗抑郁的药物来进行治疗。
脑干出血的康复治疗，可以坐在凳子和椅子上，在家属的帮助下做抬腿、伸腿和物体支撑站立，身体左右移动，蹲下等活动，运动时，应刻意使患肢负重，但应注意活动量应逐渐增加，时间不宜过度疲劳。
