常见的副作用有发热；腹泻；呕吐；食欲下降；注射部位硬结、肿胀、疼痛等，严重则会影响行动；情绪波动较大；嗜睡；入睡困难；皮疹等。除此之外，少见的有荨麻疹、呼吸困难、支气管痉挛、惊厥等。
13价肺炎疫苗的副作用主要是短暂性发热和注射部位的皮下局限性红肿结节，其特点是打首针的时候会比其他疫苗要更加明显，有些小孩在打完首针的时候，会发烧到三十八度左右，也可出现低热，到接下来的，发热并没有随剂次逐次加强，有可能低热或不再发热。
23价肺炎疫苗及肺炎多糖疫苗，能覆盖23种经常引起肺炎球菌感染的血清型。其罕见的不良反应有头痛、不适、虚弱乏力、淋巴结炎、过敏样反应、血清病、关节痛、肌痛、皮疹、荨麻疹等。
一般13价疫苗指的是13价肺炎链球菌多糖结合疫苗。现在市场上有13价的疫苗，可以预防13种肺炎链球菌血清型，因为孩子没有抗肺炎链球菌的抗体，所以儿童接种这种疫苗可以降低得肺炎的几率。接种13价肺炎疫苗后要多休息，短时间内不要进行剧烈的活动，避免出现身体的不适，同时要密切观察孩子的身体状况，发现有咳嗽、发烧等症状，应及时就诊。
13价肺炎疫苗接种的时间，分别是，宝宝在2个月、4个月、6个月的时候进行基础免疫。
在宝宝12月龄到15月龄进行一次加强免疫，全程接种4次。在接种这种疫苗后会出现一些不良的反应，比如食欲下降或者发热，同时注射部位也会出现肿胀以及红斑等，一般这些不良反应的发生率很低，不过很快就会好转。在平时要加强体育锻炼，可以增强宝宝的体质，同时也要让宝宝吃富含维生素营养高的食物。
13价肺炎疫苗能够预防脑膜炎，菌血症，肺炎以及败血症。
13价肺炎疫苗是很常见的一种疫苗，能够代表13个血清型，注射到体内能够预防13种血清型产生的抗体，能够对13种血清型的病菌有很强的抵抗能力。通常注射到体内两周后就会产生抗体。当患者出现13种血清型病原体时基本是不会引起肺炎的。注射完疫苗后，短期内应避免吃辛辣刺激的食物，注射部位应避免碰水。