小肠镜和肠镜的区别就是检查的部位不一样，如果要进行肠镜检查，需要头一天之前服用导泻剂，把肠道清理干净，第2天空腹去医院进行检查，可以检查肠道内壁的结构，对发现的病灶从不同角度观察，甚至去病理组织或者染色等。所以先通过胶囊胃镜大致定位病灶，如果同时能明确诊断那是很好的，如果没看清楚，那么小肠镜进一步明确是必要的。
肠镜和结肠镜有区别。肠镜包括结肠镜，肠镜有直肠镜，乙状结肠镜和结肠镜。检查的部位有些不同。结肠镜的检查是包括直肠和乙状结肠的。胃肠消化功能不良，需要做结肠镜和胃镜。可以到医院做全消化道的检查。
结肠镜和肠镜还是有一点区别的。
肠镜属于一个广义的范畴，其中的检查包括结肠镜、小肠镜、肛门镜，所以结肠镜只是肠镜检查范围中的一个。肠镜检查的都是肠道内的疾病，如消化系统的肿瘤占位性病变，消化道出血黏膜病变，或者不明原因的腹胀、腹泻等症状，都可以通过肠镜检查确诊。做肠镜检查前需要空腹和灌肠，清洁肠道内的垃圾，才更有利于观察肠道黏膜的变化情况。做肠镜检查有一定的不适感，因为是从肛门直接插管检查，对肠道黏膜有一定的损伤。
建议检查后饮食要清淡，多喝水，注意调养促进损伤粘膜的恢复。
肠镜检查的是大肠，小肠是看不到的。
如果要检查小肠病变，可以查胶囊内镜，能观察到小肠。肠镜检查是经肛门将肠镜循腔插至回盲部，从黏膜侧观察结肠病变的检查方法。肠镜主要是从直肠进入，经过结肠，最后看到回肠末端。肠镜检查适合大肠息肉，大肠炎症性疾病如溃疡性结肠炎、克罗恩病，慢性结肠炎、结肠癌等疾病，做肠镜之前需要禁食禁水，口服泻药。
建议在吞服胶囊内镜之后至少2小时内禁饮食，2小时后患者可饮水，4小时后可进流质、半流质饮食，检查结束后可恢复正常饮食。
观察部位不同：小肠镜主要观察小肠病变。大肠镜可以观察直肠、乙状结肠、降结肠、横结肠、升结肠，镜头可以插至末端回肠约20-30公分；小肠镜操作费时：大肠长度约1.2-1.5m，小肠长度约5-6m，所以小肠镜检查费时费力，医生操作难度较高，通常需要两只镜子分别从上下插入对接，以达到全方位观察小肠的目的。
电子肠镜说的就是肠镜，肠镜检查能看到肠腔内的所有病变，如果这次便血时间长，再做一次肠镜检查，以明确便血原因。肠镜的检查一般主要是检查肠子，主要是检查的部位是不一样的，肛门镜的检查一般考虑是在肛肠科进行，肠镜的检查，需要挂消化内科进行检查的，而且肛门镜的检查，相对比较简单，肠镜的检查相对要复杂一些。