脑干脑炎后遗症应该根据病情的严重程度来进行决定。
脑干脑炎如果是病毒感染所引起，患者会出现头痛和发热，同时还会伴随着身体虚弱，随着病情的发展，患者会出现烦躁不安和听觉困难，甚至还会伴随着嗜睡，如果没有及时的治疗，有的患者还会出现腿部肌肉无力，会对患者身体健康产生影响。
脑干脑炎患者在治疗后期应该积极的进行康复训练，配合医生治疗，能够促进病情恢复，同时也可以减轻后遗症。
想要诊断为脑干脑炎，须结合病人病史，体检、对应辅助检查方可诊断。通常可在头颅上进行磁共振检查，若病人有脑干之病灶，经头颅磁共振检查，特别是平扫+强化检查，可在病人脑干上找到某些病灶。另外还有就是脑嵴液和血液等相关的检查和分析也非常重要，因为这些都能够对脑干脑炎做出明确的诊断。另外，需配合病人脑脊液检查，例如可采用腰椎穿刺的方法，留脑脊液作相应检查。在脑嵴液中也会有很多病毒或者蛋白成分，这些都可能导致出现脑膜炎等并发症。如病人的颅内压相对较高，细胞素相对较多，接着病人生化，特别是脑脊液有异常现象，通过检测相应抗体，并对部分细菌进行了培养，病人配合头颅磁共振之检查，它可诊断为脑干脑炎。
对于脑干脑炎的患者，要先确定病因，其次要找到病因，比如病毒脑炎，霉菌性脑炎，细菌性脑炎，寄生虫性脑炎，免疫系统脑炎等。
要做好颅内核磁共振和脑脊液的病理检查和细胞学检测，明确病因，采取降颅压、抗感染、激素、免疫抑制剂等药物进行治疗，对于脑干脑炎要进行及时的处理，以免导致呼吸、心脏停止、各种并发症的发生。
脑干脑炎通常比较难治好。
脑干脑炎属于严重的脑炎，虽然一般不会出现后遗症，但脑干脑炎属于一种比较严重的神经系统感染性疾病，要想根治就很困难。在治疗时，需要使用抗感染药物、脱水剂、抗病毒药物，可以静脉注射丙种球蛋白激素。一般来说，脑干脑炎很少会出现反复发作的情况。治疗期间，患者要注意保暖，避免着凉，避免感冒，要保证充足的睡眠，同时要多吃蔬菜和水果，补充维生素，提高身体素质。
病情分析： 脑干脑炎是发生于脑干的炎性脱髓鞘病变，临床上不多见，它转化为多发性硬化的几率为30%-50%，多留有后遗症。本病的特点为：多发于青壮年；常为急性或亚急性发病，并进行性加重；发病前约有半数有上呼吸道或肠道感染史，临床表现有一侧或两侧脑干受累的症状或体征；脑脊液改变较少。
意见建议：常有前驱感染史，急性或亚急性起病，主要表现为多颅神经损害、共济失调、长束征、意识障碍。小儿报道较少，而以心血管表现为临床特点的小儿脑干脑炎更为少见。
