巧克力卵巢囊肿可采用的腹腔镜微创术治疗卵巢囊肿卵，手术治疗包括腹腔镜手术和开腹手术，可行囊肿剥离术加卵巢成形术，不需要生育的，行半保守手术，即全子宫切除加患侧附件切除术。
术后一月即可备孕。巧克力囊肿，属于子宫内膜异位症的一种临床表现。因为妊娠可使子宫内膜停止生长，所以巧克力囊肿术后应尽早妊娠可以提高受孕几率。如为腹腔镜手术，可B超监测卵巢卵泡，卵泡大小一厘米左右即可备孕。如为经腹手术，术后一月即可备孕。
想要孩子的话，巧克力囊肿的最佳治疗方法是手术治疗，因为巧克力囊肿主要是子宫内膜的异位症，如果不处理，后期越来越大对于卵巢的损害是很大的，手术后可以选择使用醋酸亮丙瑞林或戈舍瑞林治疗3到6个月，然后再怀孕。
怀孕晚期可以偶尔少量的吃巧克力，但是不能经常或大量进食，因巧克力中含有一定量的矿物质及维生素类营养素对于孕妇和孩子的身体健康发育都非常重要，但是因为其中含有咖啡因，如果过量进食则有可能引起流产或早产的不良结局。
卵巢囊肿主要分为炎症性、浆液性、粘液性、巧克力性囊肿，浆液性多为多房性囊肿，为固液性囊肿，粘液性囊肿多为单方性，液体透明性较差，巧克力囊肿典型症状为痛经，同时显示还有盆腔积液，和会阴部瘙痒，这两者都是炎症性的表现，因此初步怀疑囊肿为炎症性的。如肿瘤无并发症，极少疼痛，因此卵巢瘤病人感觉腹痛尤其突然发生者，多系瘤蒂发生扭转，或为肿瘤破裂出血或感染所致。
治疗这种病的首先就是手术治疗，能后就是用超声介入+硬化剂，这种疗法比较先进，创伤小，效果好，很多公立医院都有做这项技术。特别是三甲医院这项很好。当然，所有手术都有风险，如果您不想手术，而且目前没什么特别不舒服，也可以先中药治疗。
