阴茎短小是泌尿外科和男科比较常见的一种疾病。主要是指充分勃起后，阴茎的长度小于6cm，影响正常的性生活。比较常见的原因有阴茎先天性发育不良，隐匿阴茎，体重超标等因素引起的。通常通过视诊和局部标准测量的方式明确诊断，目前这个疾病主要的治疗方式是通过阴茎延长手术进行治疗。阴茎延长术一般可以延长阴茎的长度是2-4cm左右。
小儿阴茎短小需要考虑雄激素水平减低以及肥胖引起的假性隐形阴茎。阴茎的发育需要雄激素刺激，如果雄激素水平降低，可以导致阴茎发育迟缓短小等，需要做性激素测定。过度肥胖可以引起阴茎根部脂肪垫增厚，表现为阴茎短小，临床上称为假性隐匿性阴茎，需要控制体重。
疾病因素：近些年来，由于饮食或不良习惯等原因，使得男性隐私部位患病的几率在不断增加，如隐睾、睾丸炎等，一来会使局部组织出现水肿的情况，二来可能会影响到血管的正常血供，三来会导致阴茎短小，严重的甚至会使生精组织出现坏死的情况，对之后的生育造成一定的影响。
可以密切的观察，或者是到青春期的时候孩子自然就会发育，可以服用一些促进发育的药物，孩子再长大一些充分勃起之后的长度、粗度比较有明显的偏小和偏细的情况来说，可以通过手术来矫形治疗。
男士阴茎短小是先天性发育的，外观较大的阴茎，在勃起时所增加的长度并不大，而外观较小的阴茎，在完全勃起时长度增加更多。可见，凡是在正常范围内的阴茎在勃起状态时均可达到正常性功能的需要，不必为所谓“阴茎太短”而忧心忡忡。
