对于附睾结核治疗，如果确诊，需要定期口服抗结核药物治疗，并根据附睾结节的状况选择附睾切除术。但在手术时，需要经过一段时间的治疗结核病治疗再进行手术，避免因结核病而导致的结核病播种。
主要有几个治疗方法：物理治疗法、饮食疗法、附睾炎手术疗法等，在治疗上就应该多听听临床医生意见。附睾炎的治疗中慢性附睾炎常和慢性前列腺炎同时存在，所以，一般慢性附睾炎治疗措施与慢性前列腺炎相同，治疗前列腺炎的同时可使慢性附睾炎的症状缓解，附睾炎愈合后遗留附睾硬结，有时可造成病人的思想负担。
附睾头部囊肿是不需要治疗的，本身这种囊肿比较小，也不会有物理压迫的症状，而且属于一种良性肿瘤，囊肿属于一个囊壁组织包裹组织液形成，一般不用治疗，但是最好三到六个月复诊一次，可以观察是否增多或者短时间增大，如果没有明显变化一般不需要治疗，如果短时间增大或者增多，那么还是考虑手术进行切除，使用药物是没有效果的。
结核性附睾丸炎应该使用药物治疗。睾丸炎通常由细菌和病毒引起，睾丸本身很少发生细菌性感染，由于睾丸有丰富的血液和淋巴液供应，对细菌感染的抵抗力较强，细菌性睾丸炎大多数是由于邻近的附睾发炎引起。
结核性附睾炎，一般用药物进行治疗。治疗结核性附睾炎的药物也有很多种，用哪一种药物需要医生对病人进行检查出发病类型，然后合理用药。同时病人要养成良好的生活习惯和卫生习惯，勤换衣裤，要穿宽松的内衣内裤。注意不要吸烟，不要喝酒。
可以做阴囊B超和血液的检查。如果是细菌感染引起的，需要用消炎药。平时不要喝酒，也不要吃辣椒等食物。避免临床症状加重。需要在当地医生指导下服用药物。注意个人卫生。
