卵巢囊肿一般由于局部刺激出现囊肿的情况，如果不严重的话，可以暂时观察，如果有疼痛或者影响生殖功能的话，可以进行手术，切除治疗。也可以用中药治疗，中药治疗女性卵巢囊肿主要是从整体观入手，活血化瘀，清热解毒，全面调节内分泌让气面血活，活跃脏腑，气血是肌体的物质基础，脏腑是气血生化之源，起着分管血的生成，调节血和气的平衡作用，气是血液的原动力。
严重的卵巢囊肿建议尽快手术给与治疗，并且在月经干净三天到七天做手术，手术之前可以抽血检查妇科肿瘤三项来了解癌胚抗原癌肿抗原是否异常，患者可以选择腹腔镜手术，无论是哪种方式都建议在手术后将切除的肿瘤送病理给予化验。
如果是在手术过程中发现或者怀疑囊肿有恶性变，建议做病理切片给予诊断，再在以上的指导下决定手术范围。
一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。
常规性治疗，患从自身身体保养开始，积极进行锻炼，减少高脂肪、高糖食物的摄取，降低体重。这样可以促使雄激素水平下降，对恢复排卵有利。药物治疗，药物治疗有中西医之分，但都是调节身体，使内分泌激素正常，促进卵巢排卵。仪器治疗，运用电子声影导航仪，将多囊卵巢综合症立体定位，细如发丝的微电极置入囊腔里，吸出囊内积液，再由微电极介入治疗系统将抑制囊肿药物介入，通过电离可使囊肿组织失活。
需要手术治疗。卵巢囊肿是卵巢肿瘤的一种，各种年龄均可患病，但以20—50岁的女性最为多见，多为良性肿瘤，极少数是恶性肿瘤。可以2－3个月检查一次，若囊肿直径大于5厘米，需要手术。
