药物流产和人工流产相比较应该是药物流产损伤更小。药物流产适用于停经7周之内，并且没有药物禁忌症和药物过敏史的宫内孕患者，此时由于孕囊体积比较小，并且激素水平上升也不是很明显，可以使用口服药物的方法来终止妊娠。
药物流产和人工流产都有其优缺点。如果药物流产可以清除胚胎组织，那么药物流产对胎儿的伤害就会更低。
但是如果药物流产不彻底，宫腔里还有残留的胚胎，还要做清宫手术，药物流产的危害要远远大于流产。而人流后宫腔受到损伤，可能会引起宫腔粘连、子宫内膜脱落、宫腔感染等疾病，因此单纯的药物流产对女性的身体损害要少，不会有什么并发症。
药物流产对人体造成损伤的损伤更小，有流产需求的女性最好是去正规的医院进行药流。药物流产不仅仅是吃个药这么简单，还要进行前期和后期的检查。因此，一般不能到小诊所尽心药物流产。药物流产适用于妊娠49天以下的妇女，超过此时间，怀孕5周至10周的妇女可以进行人工流产。无论是药物流产，还是人工流产，都会给身体带来很大的危害。因此在流产以后，最好要在家中好好地养一养，多补充铁质，保持轻松，平和的心态。
人工流产和药物流产相比较，药物流产的过程中没有器械进入子宫内，流产后引起感染的可能性比较小，并且子宫内膜受伤的可能性也小。人工流产的过程中吸引器要进入子宫腔内，还要刮出子宫内壁的附着物。所以药流伤害小一些。
怀孕40天药流和人流哪个伤害小，无法比较。二者都会对身体产生一定的影响，不能机械的认为哪个伤害小。药流适用于停经49天以内的宫内孕。药流的好处是如果服药之后胎囊可以排出，复查彩超也没有残留，那么可以避免人工流产对子宫内膜的损伤，可以避免术后宫腔粘连的发生。但是如果没有顺利的排出或者复查彩超有残留，是有可能需要清宫的，那么就和人工流产的操作方式基本类似。而且药流由于出血时间长，可能增加感染的风险。人工流产的好处是可以速战速决的解决问题，适用于孕10周以内的宫内孕。但是术后可能会引起宫腔粘连。无论人流和药流，术后都有出血、感染、二次清宫、月经不调、继发不孕的风险。
一般情况下，人流和药流对身体都有一定的影响，药流对身体的危害可能会更小，具体内容如下：
通常在妊娠49天内可选择药物流产，这个时候胚胎发育还不是太完善，对于子宫内膜的伤害还比较小，但如果药流不全，可能会出现流血不止的情况，此时还需要进行清宫手术；在超过妊娠49天以后，患者则不能选择药物流产，只能进行人工流产，此时胚胎发育较大，人工流产对子宫内膜的伤害较大，所以，药流对身体的危害可能会更小，建议患者在流产后做好个人的卫生护理，多注意休息，有利于身体恢复。
