妇女孕中、晚期查彩超时，胎儿颅内囊肿明显，此时应考虑羊水穿刺以进一步诊断囊肿性质。
若是真的羊水穿刺不正常，同时考虑到胎儿畸形的话，那么就要尽早引产来终止妊娠了，毕竟胎儿畸形生产分娩之后痊愈的可能性相对较小，并且费用也是特别大的。如胎儿颅内囊肿相对较小，羊水穿刺正常，则可考虑继续怀孕，同时追踪复查彩超观察囊肿大小改变。
早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿逐渐长大后，挤压不破的情况下，可以根据自身情况，如果影响日常生活，可以到医院做手术切除囊肿，也是有一定的复发率。
颅内囊肿跟脑瘤是不同的疾病，囊肿属于良性的占位，而脑瘤是指脑部的肿瘤。囊肿也有很多不同的类型，最常见的是蛛网膜囊肿，囊肿如果小对于身体的健康没有影响，也很少出现持续的增大。而脑瘤有良性肿瘤，也有恶性肿瘤，会出现持续的增长，甚至可以危及生命。
纳氏腺囊肿又称宫颈腺体囊肿，是慢性宫颈炎的一种表现，宫颈糜烂愈合过程中，新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺口或伸入腺管，将腺管口堵塞，腺管周围的结缔组织增生或瘢痕形成压迫腺管，使腺管变窄甚至阻塞，腺体分泌物引流受阻，滞留形成的囊肿叫宫颈潴留囊肿，其包含的黏液常清澈透明，但可能由于合并感染造成混浊脓性，囊肿小而分散，可突出于子宫颈表面，小的仅有小米粒大，大的可达玉米粒大，呈青白色，可伴有糜烂。
去医院憋好尿做腹部彩超检查，到妇科医院通过正常的常规检查就可以查出来。单纯卵巢囊肿的治疗方案要到医院进行全面检查后根据囊肿大小位置进行选择，如囊肿直径小于5厘米，又无证据提示肿瘤，多为功能性囊肿，可以密切随访，即2－3个月检查一次，以后再调整检查间隔时间，若囊肿直径大于5厘米，则多为卵巢肿瘤，一般需要手术治疗。
